一、安裝ECNet （一）虛擬機使用極狐網(wǎng)站 引用鏈接： http://www.itdecent.cn/p/8afdd5b48e56 [https://www.jiansh...
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2022-11-22--期末.2一、下載數(shù)據(jù) 1. 下載參考基因組 2. 下載SAR數(shù)據(jù) 因為下載下來的文件并非輸入文件格式fasta格式，且此sar數(shù)據(jù)為雙端測序，若不拆分開，則在后續(xù)的比對中易出現(xiàn)問題，...
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2022-11-12--期末.1此次實驗操作由于參考基因組下載出問題，實驗中止，正確操作請參考下一篇。 一、下載數(shù)據(jù) 1、下載SAR數(shù)據(jù) 進入NCBIwhole genome sequencing - Bi...
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2022-09-26-----隨堂測驗下載Synechococcus elongatus UTEX 2973（accession no.為GCA_000817325.1 ）的基因組注釋文件,生成一個locus_t...
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2022-10-04---SPADS安裝1.spades安裝 tar zvxf /disk1/shares/SPAdes-3.12.0-Linux.tar.gz -C ~/Biosofts/ #將壓縮包解壓到Bio...
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2022-09-20----Fastqc安裝運行一、安裝java環(huán)境 已經(jīng)安裝好了 二、fastqc安裝 cd ~/Biosofts #進入目錄 wget http://www.bioinformatics.babraha...
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2022-10-10--Quast運行1. Quast安裝 2. 分別對Spades和velvet結果進行評價 （1）velvet的拼接 出錯 可以找到文件contigs.fa 按q退出文件 再次嘗試拼接，失敗 ...
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2022-09-19---生物軟件及應用-作業(yè)1一、下載Synechococcus elongatus UTEX 2973（accession no.為GCA_000817325.1 ）的基因組注釋文件，統(tǒng)計其中染色體序列...
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2022-09-13生物軟件應用----作業(yè)二一、安裝aspera軟件 打開虛擬機，輸入: ssh -p 6000 202031107010217(學號）@47.100.23.66 輸入密碼：bioinfo20,然后回車...