放一張效果圖，這些，三四年前的東西，我其實(shí)一直懶得說。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個(gè)功能可以說，也是一時(shí)興起寫出來的。開發(fā)的...
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TBtools | 多圖合一至強(qiáng)版教程！進(jìn)化樹 + Motifs + 結(jié)構(gòu)域 + 啟動(dòng)子 + 基因結(jié)構(gòu) + .... -
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基因組基因復(fù)制的分類鑒定：DupGen-finder
參考：http://www.itdecent.cn/p/0a14d971bd0a[http://www.itdecent.cn/p/0a14d971bd0a] requi...
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使用WGD鑒定全基因組復(fù)制
轉(zhuǎn)載自鏈接：http://www.itdecent.cn/p/3cfeb49c821a[http://www.itdecent.cn/p/3cfeb49c821a] 古老...
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使用wgd進(jìn)行全基因組復(fù)制分析這篇教程是我在2019年9月左右分析WGD時(shí)的筆記。目前來看，背景介紹和軟件使用說明都基本沒啥問題。但是現(xiàn)在更建議大家使用wgdi進(jìn)行比較基因組學(xué)中相關(guān)分析，教程見如何用WG...
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R進(jìn)行多序列比對(duì)及繪制進(jìn)化樹多序列比對(duì)Multiple sequence alignment（MSA，多序列比對(duì)）[https://zhuanlan.zhihu.com/p/671936310]大家一定...
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不出Rstudio, 實(shí)現(xiàn)從多序列比對(duì)到畫進(jìn)化樹本文是對(duì)前幾天的打臉打臉之處就在于發(fā)現(xiàn)了muscle的R包，從此不用再為序列比對(duì)東奔西跑—— Step 1. 從基因名拿到序列 這一步用到的包：biomaRt ，選擇用sym...
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相同問題，解決了嗎？
為什么orthofinder結(jié)果文件MultipleSequenceAlignments里面沒有SpeciesTreeAlignment.fa這個(gè)文件
這是我的運(yùn)行命令 重復(fù)了兩三次了 還是沒有 求救~
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你好，請(qǐng)問里面用到的腳本是哪個(gè)軟件里的，像singlecopy2tree.bash， getLongProteins.py， checkFa.py這樣的腳本
Orthofinder2鑒定單拷貝基因并構(gòu)建進(jìn)化樹
實(shí)驗(yàn)?zāi)康模罕容^基因組學(xué)，從基因組獲取單拷貝基因，并構(gòu)建有根的進(jìn)化樹，并估計(jì)分化時(shí)間，最終畫出有分化時(shí)間的進(jìn)化樹實(shí)驗(yàn)流程：orthofinder2獲取單拷貝基因——muscle...
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Where PyTorch begins
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2020年的3+分ceRNA分析長啥樣？
大家好，今天小編和大家分享的是1月份發(fā)表在Frontiers in Genetics(IF：3.517)雜志上的一篇文章，“Dysregulated lncRNA-miRNA...
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環(huán)狀RNA分析下游看了一圈，好像沒有環(huán)狀RNA分析的下游 CircRNAprofiler 是一個(gè)基于 R 的框架，只需要 R 安裝，并提供15個(gè)模塊，用于對(duì) circRNA 進(jìn)行全面的計(jì)算機(jī)分...
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小RNA分析軟件
小RNA分析軟件 新miRNA預(yù)測(cè) mireap mirdeep2 miRDeep-P/miRDP miRDP2 miR-PREFeR ShortStack miRNA靶基因...
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Risearch分析RNA與RNA之間的互作關(guān)系
Risearch分析RNA與RNA之間的互作關(guān)系 預(yù)測(cè)lncRNA和circRNA的靶基因，需要參考RNA與RNA之間的互作結(jié)果。在線平臺(tái)的RNA與RNA之間的互作關(guān)系預(yù)測(cè)也...
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RIsearch2使用方法-預(yù)測(cè)RNA-RNA互作（sRNA的靶基因）
背景 非編碼RNA經(jīng)常和其它RNAs形成配對(duì)（雙鏈）發(fā)揮其作用。這些RNA-RNA相互作用都是建立在堿基互補(bǔ)配對(duì)的基礎(chǔ)上，兩個(gè)RNA序列之間的高度互補(bǔ)是這種相互作用的強(qiáng)有力預(yù)...
