發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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一個(gè)生物信息的小白,努力發(fā)篇CNS.
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本人目前從事生信分析相關(guān)領(lǐng)域， 記錄一些常見(jiàn)的坑，也希望能幫助到類似經(jīng)歷的人。
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)<br><br>公眾號(hào)：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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@evaniali 這個(gè)需要看到你的結(jié)果才能判斷
Monocle3：擬時(shí)序分析
寫(xiě)在前面：今天突然想寫(xiě)這個(gè)教程，花了一下午看資料，其實(shí)我前面是有一些基礎(chǔ)的，但是看的還是會(huì)很亂，所以想把這個(gè)包的脈絡(luò)寫(xiě)一下，希望能夠可以跟大家討論一下并且自己以后使用這個(gè)包的...
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@1804bc936320 這個(gè)網(wǎng)上有相關(guān)的教程
Monocle3：擬時(shí)序分析
寫(xiě)在前面：今天突然想寫(xiě)這個(gè)教程，花了一下午看資料，其實(shí)我前面是有一些基礎(chǔ)的，但是看的還是會(huì)很亂，所以想把這個(gè)包的脈絡(luò)寫(xiě)一下，希望能夠可以跟大家討論一下并且自己以后使用這個(gè)包的...
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@魚(yú)嘯九天 是的，我一直推崇的是系統(tǒng)的學(xué)習(xí)生信（像某些10天學(xué)完單細(xì)胞??），不要好高騖遠(yuǎn)，要腳踏實(shí)地
芯片數(shù)據(jù)和RNA-seq的差異分析流程
由于太久沒(méi)有分析過(guò)bulk數(shù)據(jù)了，前幾天突然被要求分析一個(gè)文章的數(shù)據(jù)時(shí)有點(diǎn)亂了手腳，所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程。 假如你是小白，也剛剛了解NG...
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芯片數(shù)據(jù)和RNA-seq的差異分析流程由于太久沒(méi)有分析過(guò)bulk數(shù)據(jù)了，前幾天突然被要求分析一個(gè)文章的數(shù)據(jù)時(shí)有點(diǎn)亂了手腳，所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程。 假如你是小白，也剛剛了解NG...
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@evaniali 二者都是被接受的，適合自己文章趨勢(shì)的就是好的
Monocle3：擬時(shí)序分析
寫(xiě)在前面：今天突然想寫(xiě)這個(gè)教程，花了一下午看資料，其實(shí)我前面是有一些基礎(chǔ)的，但是看的還是會(huì)很亂，所以想把這個(gè)包的脈絡(luò)寫(xiě)一下，希望能夠可以跟大家討論一下并且自己以后使用這個(gè)包的...
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@decf782bff27 你有安裝我說(shuō)的對(duì)應(yīng)版本嗎？pyscenic改版了，需要安裝以前的版本才能夠直接用那個(gè)參考文件
SCENIC-轉(zhuǎn)錄因子分析
今天寫(xiě)一篇關(guān)于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子的分析-scenic在做分析之前你應(yīng)該看一下這篇文獻(xiàn)，看看別人做了什么scenic分析《Single-cell RNA sequencing hi...
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我認(rèn)為是：“老哥，牛逼了”
CIBERSORT：反卷積推測(cè)bulk中的細(xì)胞類型
五一學(xué)了一個(gè)新的分析方法-CIBERSORT，這個(gè)包其實(shí)很早就想學(xué)的，因?yàn)楝F(xiàn)在一般的單細(xì)胞文章的套路，很難不用到它，那么它能干什么呢？它能夠推測(cè)出bulk RNA每一個(gè)樣本中...
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十分感謝您的分享，讓我快速入門了scATAC?
單細(xì)胞筆記11-scATAC-seq上游數(shù)據(jù)處理
一直以來(lái)都不是太清楚scATAC-seq中fragments文件、peak calling，以及counts矩陣的關(guān)系，本文就來(lái)梳理一下scATAC-seq的上游數(shù)據(jù)處理中的...
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個(gè)人wx公眾號(hào)：木舟筆記。
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@起個(gè)詳亮的名字 二者之間有什么不同我也不是很懂，假如你只是用表達(dá)矩陣得到的loom文件好像不能判斷出剪切和未剪切，假如要判斷剪切和未剪切的話可以按照RNA velocity的上游分析得到的loom文件就可以得到
SCENIC-轉(zhuǎn)錄因子分析
今天寫(xiě)一篇關(guān)于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子的分析-scenic在做分析之前你應(yīng)該看一下這篇文獻(xiàn)，看看別人做了什么scenic分析《Single-cell RNA sequencing hi...
