1. 使用包繪制韋恩圖 1.1 兩個數(shù)據(jù)集 1.2 多個數(shù)據(jù)集（此處以5個為示例） 1.3 交集元素的提取 ★ 5個數(shù)據(jù)集是VennDiagram包的上限 2. 使用包繪制韋...
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R語言可視化10: 韋恩圖/upset圖 - VennDiagram/ggVennDiagram/upsetR/ComplexUpset/VennDetail -
科研繪圖——upset展示更復(fù)雜的交集情況將幾個數(shù)據(jù)集之間的交集進行可視化，除了可以利用Venn圖外，還可以使用upset這種圖形。這種方法是發(fā)表在2014年nature methods上面。Sets and int...
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R語言: 從pheatmap無縫遷移至ComplexHeatmap
pheatmap是一個非常受歡迎的繪制熱圖的R包。ComplexHeatmap包即是受之啟發(fā)而來。你可以發(fā)現(xiàn)Heatmap()函數(shù)中很多參數(shù)都與pheatmap()相同。在p...
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14高通量測序-edgeR and DESeq2, part2-獨立過濾edgeR and DESeq2, part2-獨立過濾 ? 過濾低read計數(shù)的基因，又名獨立過濾(Independent Filtering)。 ? ...
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RNA-seq 詳細教程：樣本質(zhì)控（6）學習目標 了解計數(shù)數(shù)據(jù)變換方法的重要性 了解 PCA (principal component analysis) 了解如何使用 PCA 和層次聚類評估樣本質(zhì)量 1. 質(zhì)控 ...
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DESeq2詳細用法1.構(gòu)建DESeq2對象 （1）從SummarizedExperiment對象構(gòu)建DESeqDataSet對象 se為RangedSummarizedExperiment對象...
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使用R語言rstatix包進行ANOVA并自動兩兩比較可視化關(guān)于單因素方差分析，網(wǎng)上有很多方法，比如使用R語言進行單因素方差分析以及結(jié)果可視化[https://mp.weixin.qq.com/s/PDbuql_ANZVu14Sk6V...
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R語言數(shù)據(jù)分析，從入門到自閉（圖緩慢補充中……）寫在前面 本文章參考了多個國內(nèi)外教程，在這里就不列出來了。這么寫的原因還是想告訴大家：本文章并非原創(chuàng)，感謝各位前輩的分享。 加載需要的數(shù)據(jù)包 本文章用到的數(shù)據(jù)包中，“tidy...
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gene ID / Gene Symbol / Ensembl ID
1. 各種ID名稱介紹 Gene ID 也稱Entrez ID/EntrezGene ID ，是 NCBI 使用的能夠?qū)Ρ姸鄶?shù)據(jù)庫進行聯(lián)合搜索的搜索引擎, 其對不同的 Gen...
