1.MCscanMCscan繪制共線圖MCscan需要準(zhǔn)備cds.fasta和.gff注釋文件cds.fasta文件可以從基因組序列中提取 配置layout文件 y:調(diào)整染色...
IP屬地:陜西
1.MCscanMCscan繪制共線圖MCscan需要準(zhǔn)備cds.fasta和.gff注釋文件cds.fasta文件可以從基因組序列中提取 配置layout文件 y:調(diào)整染色...
1、報錯信息:AttributeError: 'LayoutLine' object has no attribute 'color' 解決方案:在color一列輸入指定顏色...
最近發(fā)現(xiàn)了python版的MCScan,是個大寶藏。由于走了不少彎路,終于畫出美圖,趕緊記錄下來。github地址 https://github.com/tanghaibao...
call SNP GATK bwa+samtools 參考文檔 一、原始數(shù)據(jù)處理 測序得到的RAW DATA,使用NGSQCToolkit進(jìn)行過濾$PATH/Il...
寫在前面 對于沒有做過共線性分析的小伙伴,可以通過以下幾段內(nèi)容,了解一下,我為什么要費勁巴拉畫出這樣一張圖。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
以下參照 hoptop的「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)行直系同源基因分析這篇帖子試跑了一遍 1.軟件安裝 2.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 下載「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)...
基因-共線性的定義與常見算法原理 物種內(nèi)的共線性分析文件準(zhǔn)備(物種比對到自身的.blast文件,物種基因信息文件.gff文件),運(yùn)行MCScanX,輸出collinear和t...