https://github.com/bejerano-lab/percomorphCONDELs/tree/main[https://github.com/bejerano...
IP屬地：河南
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2025-07-15
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3D-old——versionYinYuan-001/muntjac_code (github.com)[https://github.com/YinYuan-001/muntjac_code] Step...
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AutoHIC 自動(dòng)糾正HiC掛載結(jié)果
相關(guān)成果發(fā)表在NAR，Zijie Jiang, Zhixiang Peng, Zhaoyuan Wei, Jiahe Sun, Yongjiang Luo, Lingzi B...
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一文了解Count、FPKM、RPKM、TPM | 相互間的轉(zhuǎn)化 | 收藏教程
PS：如果你需要本教程的練習(xí)代碼和文檔，可以在公眾號(hào)回復(fù)“20220122”即可獲得。 前言： 今早看到一篇博文，提到了FPKM與TPM間轉(zhuǎn)化。我自己也系統(tǒng)的再次進(jìn)行整理一下...
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FPKM、RPKM、TPM還在傻傻分不清？FPKM：Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped fragments(每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬映射讀取的...
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2024-04-23
methy pipeline 2024.11.26更新 https://github.com/jsh58/DMRfinder[https://github.com/jsh58...
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ROH、近交系數(shù)、親緣系數(shù)、IBD、IBS連續(xù)純合片段（runs of homozygosity, ROH）是親代將同源相同的單倍型傳遞給子代而形成的，基于ROH計(jì)算的基因組近交系數(shù)是個(gè)體真實(shí)的近交系數(shù)，它比傳統(tǒng)系譜...
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我自己寫的
QuIBL學(xué)習(xí)
QuIBL(Quantifying Introgression via Branch Lengths) 可以檢測(cè)樹不一致的情況是ILS 還是漸滲導(dǎo)致的，下面是網(wǎng)站。 步驟的操...
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基因組組裝、掛載及注釋僅供參考，友善交流 基因組survey jellyfish統(tǒng)計(jì)k-mer頻率 組裝 hifiasm組裝 其中：1.-o為輸出文件前綴2.-t表示線程3.若不需要分型組裝，可以...
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有些軟件總能以某種方式勸退你 | SpectralTAD 之 TAD calling序 言 ??有些軟件總能以某種形式勸退你，讓你毫不猶豫的投入其他軟件的懷抱，外加產(chǎn)生一種不吐不快的情愫，激發(fā)一種唯恐他人也會(huì)“遭此毒手”的正義感。軟件之所以叫做軟件，大抵是因...
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筆記：rmats繪圖結(jié)果怎么看rmats是一款比較好的分析可變剪切的分析軟件，將rmats分析的結(jié)果，利用rmats2sashimiplot繪畫出的圖也是比較漂亮的， 可變剪切事件： 可變剪切事件可以分為...
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【最新匯總】單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析與繪圖系列
分析 單細(xì)胞分析實(shí)錄(1): 認(rèn)識(shí)Cell Hashing[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkzMzE5NTM4NA==&mid=2247...
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這個(gè)鏈接里介紹了很多關(guān)于基因組學(xué)可視化工具的內(nèi)容
https://cmdcolin.github.io/awesome-genome-visualization/?latest=true[https://cmdcolin.g...
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TEclass | 對(duì)TE一致性序列進(jìn)行分類軟件安裝 軟件地址在http://www.compgen.uni-muenster.de/tools/teclass/index.hbi?[http://www.compge...
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簡(jiǎn)書筆記匯總
以下是我簡(jiǎn)書里所有的文章鏈接，按不同的專題分類，方便大家根據(jù)不同專題以及文章題目快速的查看所需內(nèi)容。 持續(xù)更新中~ Linux學(xué)習(xí)筆記 《Linux命令行與shell腳本編程...
