此圖和內(nèi)容來自文章：文超良, 孫從佼, 楊寧. 從遺傳力到腸菌力：概念及研究進(jìn)展[J]. 遺傳, 2019, 41(11): 1023-1040.視頻鏈接： https://...
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腸道微生物和宿主之間的聯(lián)合GWAS分析 -
R Interface to TensorFlow Estimators
用R也可以編寫tensorflow?，F(xiàn)在深度學(xué)習(xí)在計(jì)算機(jī)領(lǐng)域應(yīng)用得很廣，圖像識(shí)別，語音識(shí)別，等等。但是很多可以應(yīng)用但是還沒有應(yīng)用得領(lǐng)域，包括生物，醫(yī)學(xué)。R語言的深度學(xué)習(xí)為向計(jì)...
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45-R語言機(jī)器學(xué)習(xí)：神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)與深度學(xué)習(xí)《精通機(jī)器學(xué)習(xí)：基于R 第二版》學(xué)習(xí)筆記 1、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)介紹 “神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)”的概念相當(dāng)寬泛，它包括了很多相關(guān)的方法。我們主要關(guān)注使用反向傳播方法進(jìn)行訓(xùn)練的前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模...
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一文搞定深度學(xué)習(xí)建模預(yù)測(cè)全流程（Python）本文詳細(xì)地梳理及實(shí)現(xiàn)了深度學(xué)習(xí)模型構(gòu)建及預(yù)測(cè)的全流程，代碼示例基于python及神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)庫keras，通過設(shè)計(jì)一個(gè)深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型做波士頓房價(jià)預(yù)測(cè)。主要依賴的Python庫有...
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【文獻(xiàn)簡報(bào)】-深度學(xué)習(xí)在單細(xì)胞RNAseq分析中實(shí)現(xiàn)精確的聚類并去除批次效應(yīng)單細(xì)胞分析的主要問題存在較明顯的批次效應(yīng)，影響聚類效果，深度學(xué)習(xí)方法，逐漸可以應(yīng)用到單細(xì)胞分析領(lǐng)域。單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）可以通過無監(jiān)督的聚類來表征細(xì)胞類型和...
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Rakyan2011 表觀基因組范圍的關(guān)聯(lián)研究
Rakyan VK, Down TA, Balding DJ, Beck S (2011) Epigenome-wide association studies for co...
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跑通GWAS，用這些腳本就夠了最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方，先把代碼整理分享出來mark一下 前期準(zhǔn)備 1.理論知識(shí) 強(qiáng)烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...
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3K水稻SNP數(shù)據(jù)集的簡單利用3010份亞洲稻群體重測(cè)序項(xiàng)目是由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所牽頭，聯(lián)合國際水稻研究所、華大基因等16家單位共同完成。該研究對(duì)來自89個(gè)國家的3,010份水稻品種進(jìn)行了重測(cè)序...
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全基因組關(guān)聯(lián)分析 (GWAS) - 簡介在碩士就讀期間，就已經(jīng)做過 GWAS 相關(guān)的分析。當(dāng)時(shí)標(biāo)記量非常少， windows 系統(tǒng)分析就足夠了，作圖方面涉及的腳本也基本是蔡師兄幫寫的。后來，隨著高通量測(cè)序成本的降低...
