00 寫在前面 測序后公司交付數(shù)據(jù)時，一般會提供質控后的clean data和后續(xù)的基礎分析結果。因為可能需要自己來進行數(shù)據(jù)的預處理，記得一定要拿回raw data，同時弄清...
IP屬地：湖北
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測序數(shù)據(jù)基本信息統(tǒng)計 | reads,coverage,depth
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自己生成的bed文件輸出到IGV的間隙性報錯原因（勘誤版）
最近因為疫情的原因一直呆在家里，然后突然一個師兄找我要了個bed文件，然后我就從服務器上down下來給了他。但很快師兄就反饋說這個bed文件加載不到IGV里面去。一直出現(xiàn)這個...
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GFF或GTF格式轉bed
# 1. gff2bed和gtf2bed[#1-%E8%BF%99%E6%98%AF%E4%B8%80%E7%BA%A7%E6%A0%87%E9%A2%98] # 2. 自己...
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【轉】基因組比對文件（SAM/BAM） Soft Clip 與 Hard ClipClip 的含義 Clip 作為名詞講，有剪下來的東西的意義，在SAM/BAM 比對文件里面，用于描述那些一條序列上，在序列兩端，比對不上的堿基序列（還是很形象的，一條上比對...
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Python區(qū)間庫interval快速入門
前言 使用python進行數(shù)據(jù)處理的時候，有時會遇到判斷一個數(shù)是否在一個區(qū)間內的 操作，我們可以使用if else進行判斷，但是，既然使用了python，那我們當然是想找一下...
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samtools merge命令
samtools merge命令的功能描述： 當有多個樣本的bam文件時，可以使用samtools的merge命令將這些bam文件進行合并為一個bam文件。Merge命令將多...
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perl 模塊安裝與使用
查看perl 版本 查看perl模塊搜索路徑 查看某個perl模塊是否存在 模塊安裝方法1 —— 命令行形式安裝Set::IntervalTree 模塊安裝方法2 —— co...
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幾種RNA和蛋白互作檢測的實驗技術今天給大家分享幾種RNA和蛋白互作檢測的實驗技術，實驗方法在這里沒有詳細描述，只是讓大家對這幾種實驗技術原理有個初步的認識了解。感興趣的可以專門閱讀文獻去深入學習，下面我們來...
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snakemake搭建生信分析流程參考文章：https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/85330457http://www.itdecent.cn/p...
