00 寫在前面 測(cè)序后公司交付數(shù)據(jù)時(shí)，一般會(huì)提供質(zhì)控后的clean data和后續(xù)的基礎(chǔ)分析結(jié)果。因?yàn)榭赡苄枰约簛磉M(jìn)行數(shù)據(jù)的預(yù)處理，記得一定要拿回raw data，同時(shí)弄清...
IP屬地：湖北
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測(cè)序數(shù)據(jù)基本信息統(tǒng)計(jì) | reads,coverage,depth
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自己生成的bed文件輸出到IGV的間隙性報(bào)錯(cuò)原因（勘誤版）
最近因?yàn)橐咔榈脑蛞恢贝粼诩依?，然后突然一個(gè)師兄找我要了個(gè)bed文件，然后我就從服務(wù)器上down下來給了他。但很快師兄就反饋說這個(gè)bed文件加載不到IGV里面去。一直出現(xiàn)這個(gè)...
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GFF或GTF格式轉(zhuǎn)bed
# 1. gff2bed和gtf2bed[#1-%E8%BF%99%E6%98%AF%E4%B8%80%E7%BA%A7%E6%A0%87%E9%A2%98] # 2. 自己...
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【轉(zhuǎn)】基因組比對(duì)文件（SAM/BAM） Soft Clip 與 Hard ClipClip 的含義 Clip 作為名詞講，有剪下來的東西的意義，在SAM/BAM 比對(duì)文件里面，用于描述那些一條序列上，在序列兩端，比對(duì)不上的堿基序列（還是很形象的，一條上比對(duì)...
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Python區(qū)間庫(kù)interval快速入門
前言 使用python進(jìn)行數(shù)據(jù)處理的時(shí)候，有時(shí)會(huì)遇到判斷一個(gè)數(shù)是否在一個(gè)區(qū)間內(nèi)的 操作，我們可以使用if else進(jìn)行判斷，但是，既然使用了python，那我們當(dāng)然是想找一下...
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samtools merge命令
samtools merge命令的功能描述： 當(dāng)有多個(gè)樣本的bam文件時(shí)，可以使用samtools的merge命令將這些bam文件進(jìn)行合并為一個(gè)bam文件。Merge命令將多...
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perl 模塊安裝與使用
查看perl 版本 查看perl模塊搜索路徑 查看某個(gè)perl模塊是否存在 模塊安裝方法1 —— 命令行形式安裝Set::IntervalTree 模塊安裝方法2 —— co...
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幾種RNA和蛋白互作檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)今天給大家分享幾種RNA和蛋白互作檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)，實(shí)驗(yàn)方法在這里沒有詳細(xì)描述，只是讓大家對(duì)這幾種實(shí)驗(yàn)技術(shù)原理有個(gè)初步的認(rèn)識(shí)了解。感興趣的可以專門閱讀文獻(xiàn)去深入學(xué)習(xí)，下面我們來...
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snakemake搭建生信分析流程參考文章：https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/85330457http://www.itdecent.cn/p...
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數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn) | Hi-C數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)化Raw contact to .hic → juicer_tools 軟件地址：https://github.com/aidenlab/juicer/wiki/Downlo...
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Python數(shù)據(jù)可視化（九）：維恩圖繪制
使用matplotlib_venn包繪制維恩圖[#%E4%BD%BF%E7%94%A8matplotlib_venn%E5%8C%85%E7%BB%98%E5%88%B6%E...
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IGV基因組瀏覽器打開BAM文件查看reads比對(duì)情況輸入文件有：物種基因組序列文件、物種基因組注釋文件、轉(zhuǎn)錄本比對(duì)后的BAM文件；以斑胸草雀為例：-基因組注釋文件: GCF_003957565.2_bTaeGut1.4.pri...
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關(guān)于DNA正負(fù)鏈的定義
關(guān)于DNA正負(fù)鏈的定義 轉(zhuǎn)載 http://blog.sina.com.cn/s/blog_8de3399d0102ycf9.html2018-12-07 12:43:51 ...
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Illustrator 教程，如何在 Illustrator 中重新著色圖稿？歡迎觀看Illustrator教程，小編帶大家學(xué)習(xí) Illustrator 的基本工具和使用技巧，了解如何在 Illustrator 中使用 「重新著色圖稿」，完成圖稿重新著...
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AI-如何利用重新著色圖稿一秒換色我們打開AI，用矩形工具畫出四個(gè)圖案后，填充不同的顏色， 然后我們?nèi)x后，按住alt鍵后復(fù)制一層，用于與原圖對(duì)比 全部選中幾個(gè)方塊后，我們打開編輯-編輯顏色-重新著色圖稿，如...
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R包ggseqlogo |繪制序列分析圖
簡(jiǎn)介 在生物信息分析中，經(jīng)常會(huì)做序列分析圖（sequence logo），這里的序列指的是核苷酸(DNA/RNA鏈中)或氨基酸(在蛋白質(zhì)序列中)。sequence logo圖...
