DNA甲基化是一種非?；A(chǔ)且重要的表觀修飾，在調(diào)控基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合和抑制轉(zhuǎn)座子元件中起到關(guān)鍵的作用。 目前，DNA甲基化檢測(cè)的技術(shù)已經(jīng)比較成熟，例如高通量的WGBS、R...
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全基因組甲基化分析簡(jiǎn)述 -
GSEA相關(guān)筆記整理網(wǎng)頁上關(guān)于GSEA富集分析的教程很多，對(duì)自己這個(gè)生信小白來說比較簡(jiǎn)單通俗易懂的當(dāng)數(shù)生信寶典和生信技能樹的教程了。感謝大佬們的付出。下面是自己整理的個(gè)人學(xué)習(xí)筆記，可能有理解不對(duì)...
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組1】GSVA分析小鼠的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)目的：用GSVA分析單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù) 基因集變異分析（GSVA）是一種非參數(shù)，無監(jiān)督的方法，用于通過表達(dá)數(shù)據(jù)集的樣本估算基因集富集的差異，即基于通路上的差異分析 一、GSVA...
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CellRanger走起(三) 使用初探劉小澤寫于19.5.6 首先對(duì)上次改好名稱的fastq數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控 然后利用Filezilla下載其中SRR7722937的R1、R2的html，打開看下 首先是R1的，這個(gè)...
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CellRanger走起(四) Cell Ranger流程概覽劉小澤寫于19.5.7主要看流程，這一篇不涉及真實(shí)數(shù)據(jù)展示 總的來說，Cell Ranger主要的流程有：拆分?jǐn)?shù)據(jù) mkfastq、細(xì)胞定量 count、定量組合 aggr、...
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CellRanger走起(一)數(shù)據(jù)下載劉小澤寫于19.5.3 數(shù)據(jù)來自2018年9月的NC文章Acquired cancer resistance to combination immunotherapy fro...
