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0701coming最近在看網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)相關(guān)的內(nèi)容推薦一個好用的網(wǎng)站，根據(jù)蛋白質(zhì)uniprot轉(zhuǎn)換為基因名（無需代碼）https://www.uniprot.org/uploadlists/網(wǎng)站名...
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全基因組甲基化分析簡述DNA甲基化是一種非?；A(chǔ)且重要的表觀修飾，在調(diào)控基因表達、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合和抑制轉(zhuǎn)座子元件中起到關(guān)鍵的作用。 目前，DNA甲基化檢測的技術(shù)已經(jīng)比較成熟，例如高通量的WGBS、R...
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GSEA相關(guān)筆記整理網(wǎng)頁上關(guān)于GSEA富集分析的教程很多，對自己這個生信小白來說比較簡單通俗易懂的當數(shù)生信寶典和生信技能樹的教程了。感謝大佬們的付出。下面是自己整理的個人學(xué)習筆記，可能有理解不對...
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【單細胞轉(zhuǎn)錄組1】GSVA分析小鼠的單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)目的：用GSVA分析單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù) 基因集變異分析（GSVA）是一種非參數(shù)，無監(jiān)督的方法，用于通過表達數(shù)據(jù)集的樣本估算基因集富集的差異，即基于通路上的差異分析 一、GSVA...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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cellranger
系統(tǒng)配置要求： Linux至少8核（推薦16核） 64GB RAM(推薦128GB)，最低配的64G允許cellranger aggr合并最多250k個細胞 1T硬盤 64-...
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CellRanger走起(三) 使用初探劉小澤寫于19.5.6 首先對上次改好名稱的fastq數(shù)據(jù)進行質(zhì)控 然后利用Filezilla下載其中SRR7722937的R1、R2的html，打開看下 首先是R1的，這個...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負了努力
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CellRanger走起(四) Cell Ranger流程概覽劉小澤寫于19.5.7主要看流程，這一篇不涉及真實數(shù)據(jù)展示 總的來說，Cell Ranger主要的流程有：拆分數(shù)據(jù) mkfastq、細胞定量 count、定量組合 aggr、...
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下載數(shù)據(jù)
搜索GSEXXX利用prefetch下載數(shù)據(jù) prefetch安裝與使用 aspera安裝 3.數(shù)據(jù)下載 其中Acssesion list 可在GEO-SRA中下載 如果作者...
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CellRanger走起(一)數(shù)據(jù)下載劉小澤寫于19.5.3 數(shù)據(jù)來自2018年9月的NC文章Acquired cancer resistance to combination immunotherapy fro...
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創(chuàng)建新用戶
以root用戶登錄useradd -r -m -s /bin/bash [username]ll homecd /homechmod +w sudoersllvi sudoe...
