發(fā)簡信
IP屬地：青海
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Intervene: BED文件的intersect和繪制韋恩圖一、背景介紹 通常，BED文件的overlap/intersect的操作，可以BEDtools intersect功能完成overlap和統(tǒng)計：...
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如何理解BAM文件的flags每次遇到BAM文件flag值都有一些困惑，時間越久越迷惑。在此，針對BAM文件中的flag信息進(jìn)行梳理和解釋： 記錄于BAM文件的第2列，以bw...
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BETA轉(zhuǎn)錄因子與表達(dá)關(guān)聯(lián)分析今天介紹和測試這款關(guān)聯(lián)ChIP-seq、RNA-seq分析軟件，BETA（Binding and Expression Target Analy...
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HMMRATAC檢測ATAC數(shù)據(jù)的開放性
背景 目前，已經(jīng)衍生出多種用于檢測染色質(zhì)開放性的試驗方法。比如， DNase-seq， FAIRE-seq和ATAC-seq，其中ATACA-s...
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PacBio數(shù)據(jù)拆分之lima一、背 景 PacBio最新三代測序儀Sequel II芯片實現(xiàn)了更高通路，同時已經(jīng)支持barcode測序，這樣方便混合多個組織、處理、物種等...
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轉(zhuǎn)|Dockerfile構(gòu)建鏡像
發(fā)現(xiàn)一篇帖子很受用，轉(zhuǎn)載至此，別無它用，侵刪。 一、關(guān)于 Dockerfile 我們知道 Docker 鏡像的生成方式有兩種，一種是基于現(xiàn)有容器...
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了解GRO-seq什么是GRO-seq？ 來自靈魂的拷問 GRO-seq(Global nuclear Run-On sequencing)是一種專門測量新生RN...
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基于富集的5fC測序分析思路
一、過濾與質(zhì)控 測序獲得一對fastq文件，命名為treatment和control，各含兩個生物學(xué)重復(fù)，即：treatment_1、treat...
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ChIP-seq分析的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)
以下羅列了ChIP-seq數(shù)據(jù)分析中的ENCODE標(biāo)準(zhǔn)，針對不同的免疫共沉淀類型有不同的標(biāo)準(zhǔn)，以下從組蛋白和轉(zhuǎn)錄因子2個方向介紹： 一、組蛋白 ...