發(fā)簡(jiǎn)信
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TBtools繪制基因組特征圈圖circos
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破案了！blast建庫(kù)中-parse_seqids的用意
建庫(kù)的代碼，加上-parse_seqids提示 BLAST Database creation error: Near line 6001, t...
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fq轉(zhuǎn)換成fa格式
awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' fas...
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基因家族MEGA建樹及iTOL基礎(chǔ)美化【詳解注釋文件】使用MEGAX構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹 先進(jìn)行多序列比對(duì)，muscle, clustalW, 可參考文獻(xiàn)選擇一種 區(qū)別見(jiàn)：http://blog.scie...
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基因家族鑒定 hmmer+blast (含hmmer安裝)策略 hmmsearch + blast 單獨(dú)使用或者組合使用 hmmsearch可以做兩次，第一次使用pfam中的多序列比對(duì)結(jié)果構(gòu)建模型進(jìn)行搜...
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合并多個(gè)文件
目的 合并幾個(gè)txt文件，均為單列，均以SHH開(kāi)頭 解決 cmd打開(kāi)命令行 進(jìn)入放這些txt的文件夾 命令行輸入 *是通配符，匹配所有以SHH開(kāi)...
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【python腳本】計(jì)算fasta序列長(zhǎng)度;基因組contig/scaffold/chromosome長(zhǎng)度
目的 如題 腳本 來(lái)源：https://blog.csdn.net/tangxc10/article/details/48833989?utm_...
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MCScanX:分析基因組共線性
說(shuō)在前面：官網(wǎng)http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/index.php信息很全面，有示例代碼/Manual手冊(cè)，...
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Linux安裝blast+及使用
下載解壓 網(wǎng)址： https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 選...