使用cBioPortal進(jìn)行復(fù)雜的癌癥基因組和臨床profiles整合分析(Y大寬原創(chuàng),轉(zhuǎn)載需要說明) 主要來自于doi:10.1158/2159-8290.CD-12-00...
使用cBioPortal進(jìn)行復(fù)雜的癌癥基因組和臨床profiles整合分析(Y大寬原創(chuàng),轉(zhuǎn)載需要說明) 主要來自于doi:10.1158/2159-8290.CD-12-00...
前言 前面,我們介紹過了差異基因的功能富集分析,今天,我們對這部分的內(nèi)容作一些補(bǔ)充 主要介紹一下 GEVA、ssGSEA 和單基因的富集分析 GSVA 我們知道,GSEA 富...
zhuang_gj 2020/10/11 ssGSEA算法原理及應(yīng)用[#ssgsea%E7%AE%97%E6%B3%95%E5%8E%9F%E7%90%86%E5%8F%8A...
通過exprs函數(shù)獲取表達(dá)矩陣后我們可以通過以下三種方法判斷是否需要進(jìn)行l(wèi)og2轉(zhuǎn)換 1.肉眼識別 最簡單粗暴的方法就是,根據(jù)數(shù)值大小粗略估計(jì):如果表達(dá)量的數(shù)值在50以內(nèi),通...
前言 在處理數(shù)據(jù)的時(shí)候,經(jīng)常會遇到兩個(gè)名詞Scale和Normalization,這兩個(gè)名詞經(jīng)常會被混雜著使用,讓我在理解一些操作的時(shí)候經(jīng)常會迷糊,那么我就結(jié)合R語言里面的s...
出來畫圖,難免碰到個(gè)畫箭頭的需求。 簡單,如下的代碼就能安排。 畫箭頭時(shí)一些調(diào)整和參數(shù)設(shè)置,可以參考如下代碼,看看箭頭的頭和尾的圓或者鈍怎么設(shè)置。
俗話說,“獨(dú)學(xué)而無友,則孤陋而寡聞”。 為了方便大家交流學(xué)習(xí),共同進(jìn)步,我特地創(chuàng)建了?生信交流群[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4O...
規(guī)劃研究設(shè)計(jì)的最初四個(gè)步驟: 1. 找到一個(gè)題目,而這個(gè)題目要具體到你可以掌握足夠的相關(guān)信息。 2. 提出與該題目相關(guān)的問題,直到你發(fā)現(xiàn)某些引發(fā)自己興趣的問題。 3. 決定你...
跟著Cell學(xué)作圖|8.富集網(wǎng)絡(luò)圖(Cytoscape/ClueGO) “實(shí)踐是檢驗(yàn)真理的唯一標(biāo)準(zhǔn)。”“復(fù)現(xiàn)是學(xué)習(xí)R語言的最好辦法。” DOI: 10.1016/j.cell...
今天推文重復(fù)的圖來自于 論文Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestica...
1. 關(guān)于group/category 之前我一直用category來將文獻(xiàn)分組,但是自從看了官網(wǎng)的介紹后,對于group和category的使用有了新的體會。group更適...
昨天在簡村轉(zhuǎn)悠,發(fā)現(xiàn)簡友云卷云舒寫了一篇文章,題目是《是否該結(jié)束“談寫作”》,文中提到老師點(diǎn)評給出三點(diǎn)建議:一、不要總是談寫作。如果一直寫同質(zhì)化的東西,容易讓人生厭;二、要多...
在簡書里日更已經(jīng)355天了,寫了這么久,總算有了一點(diǎn)小小的成績。 今天有簡友給我留言,字?jǐn)?shù)少了,文章不錯(cuò)。這位朋友真是一針見血,這個(gè)就是我寫作的薄弱環(huán)節(jié),不知道是自己懶,還是...
昨天看了一篇文章,說目前國內(nèi)網(wǎng)絡(luò)作家已經(jīng)達(dá)到1750萬人。具體報(bào)道如下: 第六屆中國網(wǎng)絡(luò)文學(xué)論壇在內(nèi)蒙古赤峰隆重召開,大會公布了最新數(shù)據(jù): 截止目前,全國網(wǎng)絡(luò)作家的數(shù)量已經(jīng)達(dá)...
本人賀蘭岳,是3月1號來到簡書的,來到后我收獲了太多關(guān)心與厚愛!在個(gè)人成長方面我得到多位簡書前輩的提攜與指點(diǎn);在寫作投稿方面得到了“悠云閣”和“愛心小島”的加持與助力。在這個(gè)...