去年10月，我從做微生物方向的科研服務(wù)公司，跳槽到了一家準(zhǔn)一流檢驗(yàn)所新開的特檢部門。聽(tīng)說(shuō)老東家的微生物部門分崩離析，博士頭頭是去了腸道微生物相關(guān)的公司，骨干碩士去做癌癥早篩了...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山東
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且作為2022年的總結(jié)吧
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NGS原理- 轉(zhuǎn)錄組計(jì)數(shù)統(tǒng)計(jì)Readcounts-如何才是合理的
轉(zhuǎn)錄組Read Counts統(tǒng)計(jì)原理： 一般來(lái)說(shuō)是通過(guò)比對(duì)工具（如HISAT2、STAR，fanse）將測(cè)序reads比對(duì)到參考基因組使用計(jì)數(shù)工具（如HTSeq、featur...
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2025-06-16 Samtools 工具最詳細(xì)介紹
以下是對(duì) samtools 各命令的詳細(xì)中文解釋及其拓展應(yīng)用場(chǎng)景，結(jié)合功能分類和實(shí)際生物信息學(xué)分析需求整理： 一、索引命令（Indexing） dict功能：創(chuàng)建參考基因組的...
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為什么要做這樣一款用于植物基因功能注釋的軟件？
在開篇，我覺(jué)得應(yīng)該首先和同學(xué)們說(shuō)一下如題所示的問(wèn)題。我發(fā)現(xiàn)到目前為止，可用于基因功能注釋的網(wǎng)站還是有很多的，但絕大多數(shù)網(wǎng)站所收錄的植物物種實(shí)在太少而植物各物種差別又太大。舉個(gè)...
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你知道地球上有多少種生物嗎？DNA條形碼技術(shù)告訴你！歡迎來(lái)到今日的《科學(xué)快報(bào)》 地球上和海洋中究竟有多少物種？——從DNA條形碼看生物多樣性 相關(guān)研究來(lái)源于PLOS Biology期刊。 你是否曾經(jīng)好奇地想知道地球上和海洋中到...
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2025-06-16 samtools的極簡(jiǎn)生活+ 性染色體分析PSASS安裝
今天，66大順。祝大家科研順利，萬(wàn)事順心！ psass用的人不多，所以覺(jué)得說(shuō)不定可以分享一個(gè)文章，說(shuō)不定有人感興趣。 psass前幾日安裝一直不順，沒(méi)想到今日直接裝成功了，都...
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IQtree：使用 SNP 數(shù)據(jù)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹IQ-tree也是一款最大似然法構(gòu)建進(jìn)化樹的軟件，目前IQ-tree已經(jīng)更新到2.0版本功能和性能也有很大的提升，主要有四大功能，高效建樹（efficient tree re...
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snpEff注釋水稻基因組1安裝方法 首先安裝好java環(huán)境，通過(guò)官網(wǎng)下載最新版本的軟件壓縮包，然后解壓即可，最好安裝在自己熟悉的目錄下。 java檢測(cè) java -version 配置數(shù)據(jù)庫(kù) 有一些...
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入門Hifiasm?這一篇就夠了Hifiasm 使用教程 介紹 Hifiasm 是一個(gè)快速的單倍型解析 de novo 組裝軟件，最初設(shè)計(jì)用于 PacBio HiFi 讀取。其最新版本可以通過(guò)利用超長(zhǎng)的 O...
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MG2C教程-點(diǎn)點(diǎn)鼠標(biāo)就能完成畫圖MG2C是一個(gè)很純粹的工具。沒(méi)有廣告，沒(méi)有推廣，不考慮任何利益，純屬業(yè)余愛(ài)好。 MG2C是一個(gè)很“膚淺”的工具。打開使用界面，參數(shù)、輸入和輸出都在一個(gè)界面，看一眼界面就相當(dāng)于...
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不錯(cuò)，拿到MH的宣傳冊(cè)，里面看到你文章的宣傳摘要，就來(lái)搜一下，看到作者了，謝謝你開發(fā)這個(gè)小公舉??
MG2C教程-點(diǎn)點(diǎn)鼠標(biāo)就能完成畫圖
MG2C是一個(gè)很純粹的工具。沒(méi)有廣告，沒(méi)有推廣，不考慮任何利益，純屬業(yè)余愛(ài)好。 MG2C是一個(gè)很“膚淺”的工具。打開使用界面，參數(shù)、輸入和輸出都在一個(gè)界面，看一眼界面就相當(dāng)于...
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2024-11-07 秈稻粳稻基因組共線性分析-jcvi需要看下Nip和9311的基因匹配的有多少，思來(lái)想去，blast還是有點(diǎn)缺陷的，可能匹配到其他染色i他，需要用gff來(lái)幫助定一下位。所以，用基因的共線性分析看起來(lái)更合適一點(diǎn)。...
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@顧大師 先配置好該配置的所有的，然后再裝軟件試試？
好久了，我也忘記了2019-08-01 SMRTlink7.0 安裝超不順利。。。
可參考安裝流程：https://vcru.wisc.edu/simonlab/bioinformatics/programs/install/smrt.htm遇到問(wèn)題1 查找...
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2024-06-03 AI拆解高通量數(shù)據(jù)的批次效應(yīng)去除pycombat包
1. 介紹 這個(gè)代碼實(shí)現(xiàn)了一個(gè)名為Combat的類，該類用于數(shù)據(jù)的批次效應(yīng)校正。Combat (ComBat) 是一種廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)數(shù)據(jù)和其他高通量數(shù)據(jù)的批次效應(yīng)校正方法...
個(gè)人介紹
半殘科研狗
種地牧羊人
一番轉(zhuǎn)錄翻譯
終需蛋白合成
轉(zhuǎn)運(yùn)分流
還是逃不過(guò)降解代謝
罷了罷了
還是安安靜靜的做自我
種地牧羊人
一番轉(zhuǎn)錄翻譯
終需蛋白合成
轉(zhuǎn)運(yùn)分流
還是逃不過(guò)降解代謝
罷了罷了
還是安安靜靜的做自我