前言 在發(fā)表文章之前我們需要將測序的原始數(shù)據(jù)上傳到一個公共庫,并在文中提供accession number,實現(xiàn)數(shù)據(jù)的公開共享,這是國際慣例。以前我們上傳數(shù)據(jù)時只能上傳到美國...
前言 在發(fā)表文章之前我們需要將測序的原始數(shù)據(jù)上傳到一個公共庫,并在文中提供accession number,實現(xiàn)數(shù)據(jù)的公開共享,這是國際慣例。以前我們上傳數(shù)據(jù)時只能上傳到美國...
1 簡介 BCFtools 是一款多種實用工具的集合,它可以用于處理VCF文件和二進制的BCF文件。它可以接受VCF格式、壓縮的VCF格式以及BCF格式,并能自動檢測輸入的格...
多元線性回歸 多元線性回歸 是 簡單線性回歸[http://www.itdecent.cn/p/f8b2a320a767] 的擴展,用于基于多個不同的預測變量(x)預測結果...
談論到直系同源基因分析的時候,大部分教程都是介紹OrthoMCL,這是2003年發(fā)表的一個工具,目前的引用次數(shù)已經(jīng)達到了3000多,但這個軟件似乎在2013年之后就不在更新,...
這里是網(wǎng)頁版獲取DNA序列,下載保存后可以用read.fasta打開##########################用SeqinR包獲取序列并進行統(tǒng)計##########...
@equne typoras還挺只能的,哈哈~
如何在 Markdown 注釋一段文字寫代碼你可以注釋,不需要處理的代碼就 comment out。寫 Markdown 呢?一篇文章寫出來,總是有點草稿的,每次都忍痛割愛刪掉,可能下次還要再敲一遍。所以我一般都...
【樹】Linux筆記-3 shell腳本編程 以下內容是參與【生信技能樹-全球聽第7期】的課程筆記,記錄人:小瑛 ,有問題可在公眾號后臺留言小白小白,請注意:筆記中出現(xiàn)的所...
variable sites informative sites nucleotide diversity 信息位點的定義:在兩個及以上分類單元(的序列)中存在差異,且其中至...
葉綠體基因組的文章中通常會有一小部分內容是運用DnaSp軟件來進行核苷酸多態(tài)性π分析,斷斷續(xù)續(xù)看了也好長時間了,今天終于重復出了結果,簡單記錄自己的重復過程: 論文:comp...
前言 最近在看一些關于生態(tài)、遺傳、基因組進化等的文獻,其中有個很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值,(Ka/Ks)。發(fā)現(xiàn)在國內的資料中比較少,即使有,也只是教大家...
以下內容是參與【生信技能樹-全球聽第7期】的課程筆記,記錄人:小瑛 ,有問題可在公眾號后臺留言小白小白,請注意:筆記中出現(xiàn)的所有文件路徑,僅作為參考,請勿模仿! 1. co...
以下內容是參與【生信技能樹-全球聽第7期】的課程筆記,記錄人:小瑛 ,有問題可在公眾號后臺留言小白小白,請注意:筆記中出現(xiàn)的所有文件路徑,僅作為參考,請勿模仿! 1. 登錄...
shenwei爪哥開發(fā)的處理Fasta/Fastq文件的萬能工具。之前處理fq/fa文件時花時間寫的一些腳本發(fā)現(xiàn)在seqkit里直接能一行命令就解決。實在是提升效率,整合流程...