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國產(chǎn)測序儀之賽納生物測序技術(shù)路線介紹
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2020-05-11-MSI算法-msisensor計算原理
MSI msisensor 計算msi原理 MSI突變中重復(fù)至少5次的1-5個堿基的序列。然后，使用MSIsensor msi命令，通過使用卡方檢驗(yàn)比較腫瘤和正常樣品之間的讀...
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snakemake--我最喜歡的流程管理工具使用Snakemake搭建分析流程 目前已有的框架 A review of bioinformatics pipeline framework 的作者對已有的工具進(jìn)行很好的分...
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Nextflow 快速搭建生信分析流程（一）生物信息分析中流程搭建是所有組學(xué)分析過程中必不可少的環(huán)節(jié)，目前市面上一些主流的生信類的公司（包括貝瑞、華大、諾禾等）在流程搭建過程中還主要依靠perl和python以及she...
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GenFuse:一種可以從DNA數(shù)據(jù)預(yù)測融合基因的方法2018年，海普洛斯的科研人員發(fā)表了一篇用DNA數(shù)據(jù)直接預(yù)測融合基因的文章，標(biāo)題事”GeneFuse: detection and visualization of targ...
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minio原理和使用簡介 Minio 是一個基于Apache License v2.0開源協(xié)議的對象存儲服務(wù)。它兼容亞馬遜S3云存儲服務(wù)接口，非常適合于存儲大容量非結(jié)構(gòu)化的數(shù)據(jù)，例如圖片、視頻、...
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NGS 數(shù)據(jù)過濾之 Trimmomatic 詳細(xì)說明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對后續(xù)分析至關(guān)重要，去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率。Trimmomatic 是...
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一次用爬蟲爬取數(shù)據(jù)庫的小記一、需求 所要爬取的數(shù)據(jù)庫是CKB數(shù)據(jù)庫 點(diǎn)擊進(jìn)入Genes頁面 可以看到對應(yīng)的頁面下，存在箭頭所指的兩個表格而，需求就是將所有藍(lán)色部分的gene所對應(yīng)的這兩個表格爬取下來 ...
