導(dǎo)讀 平時看文章,特別是組學(xué)文章,作者在文末都會提供其研究材料中高通量測序數(shù)據(jù)的下載鏈接,如果平時想練手的話,下載這些數(shù)據(jù)是最好不過了,下面我就總結(jié)下如何從GEO和SRA中下...
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導(dǎo)讀 平時看文章,特別是組學(xué)文章,作者在文末都會提供其研究材料中高通量測序數(shù)據(jù)的下載鏈接,如果平時想練手的話,下載這些數(shù)據(jù)是最好不過了,下面我就總結(jié)下如何從GEO和SRA中下...
前言 很多人問我有沒有關(guān)于全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)原理的書籍或者文章推薦。 其實我個人覺得,做這個分析,先從跑流程開始,再去看原理。 為什么這么說呢,因為對于初學(xué)者來說,...
前言 俗話說“文獻(xiàn)是最好的老師”,但是隔行如隔山,在科研界,隔著一個領(lǐng)域就有一個巨大的鴻溝。就比如就算做腫瘤研究的人,看免疫學(xué)領(lǐng)域的文章還是會頭皮發(fā)麻,看到總是記不住的CD4...
clusterProfiler包是Y叔開發(fā)的一個強(qiáng)大的能進(jìn)行多種功能富集的R包,對于有OrgDb或AnnotationHub中收錄的物種進(jìn)行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
1,參考腳本: nohup /home/zxd/software/trinityrnaseq-Trinity-v2.4.0/Trinity --seqType fq --ma...
寫在前面 幾乎每年的8月份,都是科研大神們比較關(guān)注的日子,因為自己年初苦心經(jīng)營的基金申請結(jié)果即將揭曉。那么究竟花落誰家,其實早有定數(shù)(當(dāng)然要建立在通宵達(dá)旦的碼字以及契合審稿人...
本文是對前幾天的打臉打臉之處就在于發(fā)現(xiàn)了muscle的R包,從此不用再為序列比對東奔西跑—— Step 1. 從基因名拿到序列 這一步用到的包:biomaRt ,選擇用sym...