導(dǎo)讀 平時看文章，特別是組學(xué)文章，作者在文末都會提供其研究材料中高通量測序數(shù)據(jù)的下載鏈接，如果平時想練手的話，下載這些數(shù)據(jù)是最好不過了，下面我就總結(jié)下如何從GEO和SRA中下...
發(fā)簡信
IP屬地：山東
-
如何下載文章提供的測序數(shù)據(jù) -
全基因組關(guān)聯(lián)分析學(xué)習(xí)資料（GWAS tutorial）
前言 很多人問我有沒有關(guān)于全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）原理的書籍或者文章推薦。 其實我個人覺得，做這個分析，先從跑流程開始，再去看原理。 為什么這么說呢，因為對于初學(xué)者來說，...
-
m6A甲基化對我來說就是好新鮮
前言 俗話說“文獻(xiàn)是最好的老師”，但是隔行如隔山，在科研界，隔著一個領(lǐng)域就有一個巨大的鴻溝。就比如就算做腫瘤研究的人，看免疫學(xué)領(lǐng)域的文章還是會頭皮發(fā)麻，看到總是記不住的CD4...
-
使用clusterProfiler包對非模式生物進(jìn)行GO和KEGG的富集分析
clusterProfiler包是Y叔開發(fā)的一個強(qiáng)大的能進(jìn)行多種功能富集的R包，對于有OrgDb或AnnotationHub中收錄的物種進(jìn)行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
-
無參轉(zhuǎn)錄組分析：使用 Trinity 進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本拼接（參考腳本）1，參考腳本： nohup /home/zxd/software/trinityrnaseq-Trinity-v2.4.0/Trinity --seqType fq --ma...
-
和你息息相關(guān)——國自然基金標(biāo)題爬取寫在前面 幾乎每年的8月份，都是科研大神們比較關(guān)注的日子，因為自己年初苦心經(jīng)營的基金申請結(jié)果即將揭曉。那么究竟花落誰家，其實早有定數(shù)（當(dāng)然要建立在通宵達(dá)旦的碼字以及契合審稿人...
-
不出Rstudio, 實現(xiàn)從多序列比對到畫進(jìn)化樹本文是對前幾天的打臉打臉之處就在于發(fā)現(xiàn)了muscle的R包，從此不用再為序列比對東奔西跑—— Step 1. 從基因名拿到序列 這一步用到的包：biomaRt ，選擇用sym...
