今天要做的是seurat 的3000 PBMC 的分析。(https://www.bilibili.com/video/BV14q4y1J7MS?spm_id_from=33...
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@范垂欽_92be 已解決,非常感謝??
irGSEA:基于秩次的單細(xì)胞基因集富集分析整合框架(修訂版)一、背景 許多Functional Class Scoring (FCS)方法,如GSEA, GSVA,PLAGE, addModuleScore, SCSE, Vision...
@范垂欽_92be seurat是4.3.0.1
Matrix是1.6-1
irGSEA:基于秩次的單細(xì)胞基因集富集分析整合框架(修訂版)一、背景 許多Functional Class Scoring (FCS)方法,如GSEA, GSVA,PLAGE, addModuleScore, SCSE, Vision...
您好,想問一下運(yùn)行到irGSEA.score報錯了Error in validityMethod(as(object, superClass)) :
object 'Csparse_validate' not found
是哪步有問題呀,我需要怎么處理呢
irGSEA:基于秩次的單細(xì)胞基因集富集分析整合框架(修訂版)一、背景 許多Functional Class Scoring (FCS)方法,如GSEA, GSVA,PLAGE, addModuleScore, SCSE, Vision...
請問你下你的富集結(jié)果文件是什么格式的呀,我讀入了cvs或者txt都不行,要不就是找不到對象,要不就是選擇了未定義的列
GO富集結(jié)果進(jìn)行圖形繪制怎么將得到的Go富集[http://www.itdecent.cn/p/638c4e3fba35]的結(jié)果進(jìn)行可視化呢?本文使用ggplot2進(jìn)行繪圖。 首先我們先看一下上文...
您好,想問一下運(yùn)行最后代碼顯示無效的十六進(jìn)制書是什么原因
跟著Cell學(xué)作圖:R語言ggplot2作圖展示差異表達(dá)的基因一組對照加處理這種實(shí)驗(yàn)的差異表達(dá)分析結(jié)果通常是用火山圖來展示,如果是很多組實(shí)驗(yàn)的話如何展示,這種情況我之前還沒有遇到過。公眾號后臺有讀者留言問到了如下的圖 這個圖來自于論文A...