參考: [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...
@熱愛大自然的小和尚 感謝感謝?。?
生信學習筆記:使用SNP data做基因滲入分析 (4)繼續(xù)上一周的內容,上次講到了如何使用--tree Dsuite的功能。要使用--treeDsuite的功能,我們顯然需要一個樹文件。一般樹文件可以通過SNP數(shù)據(jù)畫取進化樹來獲...
@番茄_9493 你安裝LD-deca那里有呀
LD衰減圖的理解與應用在群體遺傳學研究中,LD連鎖不平衡分析是最常見的分析內容,也是關聯(lián)分析的基礎。如何正確理解并且進行相關的LD連鎖不平衡分析是群體遺傳中很基本的一件事情。下面和大家一起學習一下...
工具介紹 Mash擴展了MinHash降維技術,使其成對的突變距離和P值顯著性檢驗,從而可以有效地聚類和搜索大量序列集合?;齑顚⒋笮蛄泻托蛄屑€原為較小的代表性草圖,進而可以...
由于臨近博士畢業(yè),沒有再進行更多的生信技能的學習,主要精力都是放在文章發(fā)表,畢業(yè)論文寫作方面。今天的推文繼續(xù)和大家分享一篇非常好的文章“What makes a plant ...
讀文獻是每個科研工作者的必修課。無論你是科研小白,你需要通過讀文獻來入門你所感興趣的領域。又或者你是學有所成領域內的專家,也要通過讀文獻來了解領域內的最新發(fā)現(xiàn)來修煉內功,擴充...
@不整點沒靈感 我不太了解哦這方面。我知道的是如果你數(shù)據(jù)缺失比較多是需要的
群體遺傳學習筆記-基因型缺失數(shù)據(jù)的填充Genotype Imputation是在高通量測序中常出現(xiàn)的定義,按照義譯就是基因型填充。要真正理解imputation這個概念,我們就需要先理解基因型缺失(genotyp...
@我們一起舔過鐵欄桿 10乘的測序深度
群體遺傳學習筆記-基因型缺失數(shù)據(jù)的填充Genotype Imputation是在高通量測序中常出現(xiàn)的定義,按照義譯就是基因型填充。要真正理解imputation這個概念,我們就需要先理解基因型缺失(genotyp...
@13618622625 簡書把github的圖屏蔽了,我沒有重新做床,你可以去github網(wǎng)上去看看
變異vcf文件可視化神器今天給大家?guī)硪豢罘浅7奖愫糜玫腟NP變異vcf文件可視化神器:VariantQC。聽到這個名字有沒有似曾相識的感覺,嘿嘿嘿。沒錯,那就是FastqC了。相信大家對這個軟件肯...
是的是的,打錯了。我來改一改
謝謝提醒
LD衰減圖的理解與應用在群體遺傳學研究中,LD連鎖不平衡分析是最常見的分析內容,也是關聯(lián)分析的基礎。如何正確理解并且進行相關的LD連鎖不平衡分析是群體遺傳中很基本的一件事情。下面和大家一起學習一下...
是的是的,打錯了。我來改一改
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熟悉R的朋友都會知道,dplyr包是對原始的數(shù)據(jù)集進行清洗、整理以及變換的有力武器之一。但是其使用會局限于你需要有打開R/R studio或者通過R腳本來執(zhí)行dplyr。對于...