主要講述PyMOL中常見的圖形界面（鼠標(biāo)）操作 1.認(rèn)識(shí)PyMol 1. 軟件界面介紹 1.2 內(nèi)置demo介紹 打開PyMOL,點(diǎn)擊1.1菜單窗口的Wizard菜單，然后點(diǎn)...
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【軟件使用】PyMol入門教程 -
跟著Nature microbiology學(xué)畫圖~R語言ggtree展示進(jìn)化樹今天要模仿的圖片來自于論文 Core gut microbial communities are maintained by beneficial interactions ...
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跟著Nature Communications學(xué)數(shù)據(jù)分析：R語言DESeq2包做otu差異豐度分析及火山圖展示結(jié)果論文 Microbiome differential abundance methods produce different results across 38 datase...
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使用clusterProfiler進(jìn)行富集分析clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包，看過了它的繪圖就會(huì)使人沉迷于其顏值無法自拔。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔，加上了我的測(cè)試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）。 一、...
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IGV導(dǎo)出SVG圖片導(dǎo)入到AI里的方法
前言 從IGV里導(dǎo)出矢量圖格式SVG，雖然可以直接用chrome查看，但是用AI打開編輯時(shí)會(huì)報(bào)錯(cuò)，并只剩下框架，沒有各個(gè)tracks，如下圖： 有些版本還會(huì)報(bào)帶有Tiny的提...
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富集分析天花板之ClusterProfiler4說在前面 在國(guó)內(nèi)做生信的小伙伴或多或少都聽過一個(gè)大名鼎鼎的名字---Y叔，想當(dāng)初小編初入生信大門時(shí)還專門百度查了一下，他就是南方醫(yī)科大學(xué)生物信息學(xué)系主任余光創(chuàng)教授。Y叔在國(guó)際...
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在熱圖中標(biāo)注出特定基因的名稱對(duì)于基因的差異表達(dá)譜，常用熱圖作為展示。但有時(shí)差異基因可能非常的多，熱圖中不可能將所有基因的名稱標(biāo)注出來。那么此時(shí)不妨選擇一些比較重要的基因（比方說p值最顯著的那些），在圖中...
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如何給熱圖heatmap添加指定的標(biāo)簽？當(dāng)我們畫熱圖（heatmap）的時(shí)候，如果基因的名字比較多的時(shí)候，在熱圖中展示的話，就會(huì)出現(xiàn)名字重疊的情況，針對(duì)這個(gè)情況，我們有兩種比較好的解決辦法，第一是在熱圖中僅顯示關(guān)注...
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pheatmap熱圖技巧合集突然間發(fā)現(xiàn)，我一做熱圖就用pheatmap幾乎不存在第二個(gè)選項(xiàng)了。是時(shí)候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一個(gè)值得注意的參數(shù)，它旨在說明你想...
個(gè)人介紹
抓娃娃大賽全國(guó)十六強(qiáng)
細(xì)胞生物學(xué)博士
努力??學(xué)習(xí)生物信息ing~
博士期間研究方向：昆蟲嗅覺感受，性信息素合成的分子機(jī)制；
博后現(xiàn)階段研究方向：蚊媒病毒神經(jīng)細(xì)胞嗜性的細(xì)胞分子機(jī)制
歡迎關(guān)注公眾號(hào)：我們一起學(xué)生信
細(xì)胞生物學(xué)博士
努力??學(xué)習(xí)生物信息ing~
博士期間研究方向：昆蟲嗅覺感受，性信息素合成的分子機(jī)制；
博后現(xiàn)階段研究方向：蚊媒病毒神經(jīng)細(xì)胞嗜性的細(xì)胞分子機(jī)制
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