大概是長(zhǎng)期的不鍛煉使得今天的爬山運(yùn)動(dòng)過量了,接著悲劇就是無法入眠。也幸虧明天是周日,干脆就起床碼字了??偨Y(jié)下自己前面用snp構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹的方法吧。 1.構(gòu)建進(jìn)化樹的算法 構(gòu)...
一、什么是批次效應(yīng) 批次效應(yīng)(batch effect),表示樣品在不同批次中處理和測(cè)量產(chǎn)生的與試驗(yàn)期間記錄的任何生物變異無關(guān)的技術(shù)差異。批次效應(yīng)是高通量試驗(yàn)中常見的變異來源...
比起原文少了些關(guān)鍵的判斷,建議看原文
R語言機(jī)器學(xué)習(xí)-caret介紹 caret包(Classification and Regression Training)是一系列函數(shù)的集合,它試圖對(duì)創(chuàng)建預(yù)測(cè)模型的過程進(jìn)行流程化。本系列將就數(shù)據(jù)預(yù)處...
methylKit可以用來尋找DMR/DMC,其統(tǒng)計(jì)方法如下: logistic regression Fisher exact test 有重復(fù)時(shí)methylKit調(diào)用 l...
網(wǎng)頁上關(guān)于GSEA富集分析的教程很多,對(duì)自己這個(gè)生信小白來說比較簡(jiǎn)單通俗易懂的當(dāng)數(shù)生信寶典和生信技能樹的教程了。感謝大佬們的付出。下面是自己整理的個(gè)人學(xué)習(xí)筆記,可能有理解不對(duì)...
開花植物中可根據(jù)甲基化富集的區(qū)間將基因分為五類: UM(umethylated genes)在gene body上三種甲基化context都不富集 gbM(gene body...
在準(zhǔn)備NGS文庫(kù)的時(shí)候,會(huì)有用到轉(zhuǎn)座酶Tn5,Nextera DNA Library Preparation Kit ,比如ATAC-seq就有用到這個(gè)Tn5。轉(zhuǎn)座酶攜帶有特...
鏈接來源 一切版權(quán)來源參考鏈接:此處只是用來記錄和不能出去的情況。 Tutorial: Normalization of BigWig files using TMM fro...
分類 轉(zhuǎn)座元件,是一種跳躍基因,是指一段DNA序列由基因組的一個(gè)位置跳躍到另一個(gè)位置,由Barbara McClintock教授在大約五十年前發(fā)現(xiàn)。轉(zhuǎn)座子主要包含兩種類型:一...
@ice白先森 我也是,4點(diǎn)的時(shí)候這個(gè)角落真的很漂亮
冬天的上海動(dòng)物園冬天是個(gè)容易自閉的季節(jié),凜冽寒風(fēng)不僅吹透了衣服,更吹進(jìn)了心里。每到冬天我就很羨慕變溫動(dòng)物,可以通過冬眠來逃避這段寒冷蕭瑟的時(shí)光。這個(gè)冬天我在某人的影響下,想改變一下自己的生活...
1. 昨天在圖書館,被坐在對(duì)面的留學(xué)生問:“are you tired?” 聽到這個(gè)問題的那一瞬間,我竟不知道怎么去回答。 可能在旁觀者的他看來,這個(gè)女生已經(jīng)將近半個(gè)月都沒有...
冬天是個(gè)容易自閉的季節(jié),凜冽寒風(fēng)不僅吹透了衣服,更吹進(jìn)了心里。每到冬天我就很羨慕變溫動(dòng)物,可以通過冬眠來逃避這段寒冷蕭瑟的時(shí)光。這個(gè)冬天我在某人的影響下,想改變一下自己的生活...