歡迎關(guān)注，同名公主號(hào)，BBio 一般來說，無論是人工還是軟件自動(dòng)注釋，都要先進(jìn)行無監(jiān)督的聚類，然后以 cluster為單位進(jìn)行注釋。文章通過比較32款工具的準(zhǔn)確性、運(yùn)行時(shí)間等...
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文獻(xiàn)速遞||綜述-單細(xì)胞自動(dòng)化注釋32款工具的比較及SingleR簡介 -
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù) 細(xì)胞注釋指南
細(xì)胞注釋是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析的重要環(huán)節(jié)，來自加拿大的研究人員在《Nature protocols》發(fā)表細(xì)胞注釋教程綜述，介紹了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中細(xì)胞注釋的一般工作流程，涵蓋...
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DatabaseImmuneCellExpressionData()下載異常問題解決
DatabaseImmuneCellExpressionData數(shù)據(jù)集時(shí)，出現(xiàn)同一個(gè)錯(cuò)誤： > ref <- DatabaseImmuneCellExpressionD...
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利用r語言實(shí)現(xiàn)DNA雙序列全局比對(duì)（Needleman-wunsch算法)序列比對(duì)實(shí)驗(yàn)報(bào)告 一．實(shí)驗(yàn)內(nèi)容 1.利用序列比對(duì)線上工具做序列比較2.Blast線上工具使用3.使用r語言實(shí)現(xiàn)Needleman-Wunsch算法 二．實(shí)驗(yàn)?zāi)康?1.掌握序列...
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R 缺失值處理處理方法：常規(guī)方法 由mape（Mean absolute percentage error，平均絕對(duì)百分比誤差）可知，以上的效果都不咋的，隨機(jī)填補(bǔ)的效果竟然處于第一等（和平...
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sva_combat校正批次效應(yīng)安裝包 使用內(nèi)置數(shù)據(jù) 使用Hierarchical clustering的方法去看一下聚類的情況 校正批次效應(yīng),model可以有也可以沒有，如果有，也就是告訴combat，有...
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如何用R語言優(yōu)雅地寫作（一）R Markdown:Elegant, flexible and fast dynamic report generation with R 如果你已經(jīng)厭倦 Word 或 P...
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R語言進(jìn)階路上||遇見apply函數(shù)家族在使用R語言進(jìn)行數(shù)據(jù)分析時(shí)，我們發(fā)現(xiàn)一個(gè)重要的部分就是對(duì)數(shù)據(jù)的處理和轉(zhuǎn)化。真正的統(tǒng)計(jì)建模以及數(shù)據(jù)可視化均有相應(yīng)的函數(shù)來完成——需要我們把數(shù)據(jù)整理（tidy）成所用函數(shù)需要的格...
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R語言：統(tǒng)計(jì)多個(gè)數(shù)據(jù)框中分類變量各值的頻數(shù)導(dǎo)讀 查看文件、獲取ID讀取數(shù)據(jù)表讀取數(shù)據(jù)表 一、查看文件、獲取ID 關(guān)鍵參數(shù)：list.files(pattern="條件") # 根據(jù)條件獲取文件名strsplit(向...
