歡迎關(guān)注，同名公主號，BBio 一般來說，無論是人工還是軟件自動注釋，都要先進行無監(jiān)督的聚類，然后以 cluster為單位進行注釋。文章通過比較32款工具的準確性、運行時間等...
IP屬地：河南
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文獻速遞||綜述-單細胞自動化注釋32款工具的比較及SingleR簡介 -
單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù) 細胞注釋指南
細胞注釋是單細胞轉(zhuǎn)錄組分析的重要環(huán)節(jié)，來自加拿大的研究人員在《Nature protocols》發(fā)表細胞注釋教程綜述，介紹了單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中細胞注釋的一般工作流程，涵蓋...
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感謝你的分享，幫我解決了同一個問題
DatabaseImmuneCellExpressionData()下載異常問題解決
DatabaseImmuneCellExpressionData數(shù)據(jù)集時，出現(xiàn)同一個錯誤： > ref <- DatabaseImmuneCellExpressionD...
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DatabaseImmuneCellExpressionData()下載異常問題解決
DatabaseImmuneCellExpressionData數(shù)據(jù)集時，出現(xiàn)同一個錯誤： > ref <- DatabaseImmuneCellExpressionD...
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利用r語言實現(xiàn)DNA雙序列全局比對（Needleman-wunsch算法)序列比對實驗報告 一．實驗內(nèi)容 1.利用序列比對線上工具做序列比較2.Blast線上工具使用3.使用r語言實現(xiàn)Needleman-Wunsch算法 二．實驗目的 1.掌握序列...
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R 缺失值處理處理方法：常規(guī)方法 由mape（Mean absolute percentage error，平均絕對百分比誤差）可知，以上的效果都不咋的，隨機填補的效果竟然處于第一等（和平...
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sva_combat校正批次效應安裝包 使用內(nèi)置數(shù)據(jù) 使用Hierarchical clustering的方法去看一下聚類的情況 校正批次效應,model可以有也可以沒有，如果有，也就是告訴combat，有...
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如何用R語言優(yōu)雅地寫作（一）R Markdown:Elegant, flexible and fast dynamic report generation with R 如果你已經(jīng)厭倦 Word 或 P...
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R語言進階路上||遇見apply函數(shù)家族在使用R語言進行數(shù)據(jù)分析時，我們發(fā)現(xiàn)一個重要的部分就是對數(shù)據(jù)的處理和轉(zhuǎn)化。真正的統(tǒng)計建模以及數(shù)據(jù)可視化均有相應的函數(shù)來完成——需要我們把數(shù)據(jù)整理（tidy）成所用函數(shù)需要的格...
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R語言：統(tǒng)計多個數(shù)據(jù)框中分類變量各值的頻數(shù)導讀 查看文件、獲取ID讀取數(shù)據(jù)表讀取數(shù)據(jù)表 一、查看文件、獲取ID 關(guān)鍵參數(shù)：list.files(pattern="條件") # 根據(jù)條件獲取文件名strsplit(向...
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【文獻】單細胞 T細胞受體(TCR)測序：技術(shù)與挑戰(zhàn)Single Cell T Cell Receptor Sequencing: Techniques and Future Challenges單細胞T細胞受體測序：技術(shù)與挑...
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Seurat的單細胞免疫組庫分析來了！
使用Seurat進行單細胞VDJ免疫分析 NGS系列文章包括NGS基礎(chǔ)、轉(zhuǎn)錄組分析（Nature重磅綜述|關(guān)于RNA-seq你想知道的全在這）、ChIP-seq分析（ChIP...
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Mac上使用FFmpeg想要在Mac上下載m3u8格式的視頻 可以使用VLC播放器觀看存儲，不過有一定的局限性，轉(zhuǎn)換視頻會有馬賽克 1.打開終端執(zhí)行 首先安裝FFmpeg 需要Homebrew[ht...
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?；鶊D繪制（sankey diagram）R常用的方法有：ggalluvial[http://www.itdecent.cn/p/148ca7c7af59]sankeyNetwork[https://www.jia...
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免疫組庫分析軟件MiXCR的安裝和使用安裝 conda安裝 普通安裝 在Mac OS X上使用Homebrew或者在Linux系統(tǒng)上使用linuxbrew安裝 將已經(jīng)安裝的MiXCR更新到最新版本 手動安裝 在r...
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Mac上如何讀寫移動硬盤？三款NTFS讀寫軟件分享給大家NTFS是微軟開發(fā)的，在目前使用的大部分電腦操作系統(tǒng)上，都支持此類格式的讀寫。然而Mac電腦上無法通過正規(guī)途徑進行NTFS格式硬盤的寫入，怎么解決這個難題呢？三款NTFS讀寫...
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單細胞轉(zhuǎn)錄組測序分析--初探Seurat單細胞轉(zhuǎn)錄組測序--閑言碎語 時代發(fā)展的步伐總是毫不留情的將你甩在身后，連車尾燈都看不見。當你還在沉迷于普通轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘時，已經(jīng)有人悄悄的搞上單細胞了。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序，顧...
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單細胞測序（scRNA-seq）通關(guān)||數(shù)據(jù)處理必知必會單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系列教程 sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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macOS Catalina開啟讀取NTFS功能開啟Mac自帶的讀取NTFS功能 有的同學用Paragon，有的同學用Tuxera，我就偏偏不用（沒錢但又理直氣壯）好像是因為NTFS是微軟的技術(shù)不讓用，所以Mac默認關(guān)閉了...
