各位看官老爺們大家好，俗話說，萬丈高樓平地起，今天就帶大家學(xué)習(xí)下生物信息學(xué)習(xí)過程經(jīng)常用到的最基礎(chǔ)但也是最實(shí)用的一些linux命令，當(dāng)你的小伙伴們還在使用鼠標(biāo)點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)的時(shí)候，你只...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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常用的一些linux基礎(chǔ)命令
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【生信實(shí)戰(zhàn)】只會(huì)GO/KEGG，何不試試Reactome數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行富集分析REACTOME 是一個(gè)開源、放開、人工整理并經(jīng)過同行評(píng)審的通路數(shù)據(jù)庫(kù)。目標(biāo)是為各個(gè)通路提供可視化、可解釋的分析，以支持基礎(chǔ)研究、臨床研究、基因組分析、建模、系統(tǒng)生物學(xué)等。 ...
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使用wget下載GEO數(shù)據(jù)我們有時(shí)需要下載GEO數(shù)據(jù)，使用getGEO的話比較麻煩，特別是當(dāng)我們只需要其中某一兩個(gè)文件時(shí)。但是當(dāng)我們直接復(fù)制文件鏈接，使用wget下載時(shí)，卻只能下載當(dāng)前的網(wǎng)頁(yè)。 經(jīng)過我...
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單細(xì)胞表達(dá)矩陣文件轉(zhuǎn)換
先附上學(xué)習(xí)連接https://mp.weixin.qq.com/s/NaZ5kz3ew2O01cFEnK8sXg這個(gè)問題之前也遇到過，在此搬個(gè)小板凳來學(xué)習(xí)學(xué)習(xí) 數(shù)據(jù)下載 由于...
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TCGA / 組織來源編碼 / Tissue Source Site Codes
Tissue Source Site Codes TSS CodeSource SiteStudy NameBCR01International Genomics Conso...
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多種方法實(shí)現(xiàn)基因ID SYMBOL 與 ENTREZID轉(zhuǎn)換方法一 ID轉(zhuǎn)換，ENTREZID是進(jìn)行GO分析最好的ID類型（針對(duì)clusterProfiler）ID轉(zhuǎn)換用到的是bitr()函數(shù)，但我的SYMBOL 轉(zhuǎn) ENTREZID...
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跟著Nature Metabolism學(xué)作圖:R語(yǔ)言ggplot2熱圖組合樹圖和雙層分組標(biāo)記論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specif...
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TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的利用（一）—— 數(shù)據(jù)下載！前序 還有1個(gè)多月就要畢業(yè)了，而在此之前需要順利完成自己的畢設(shè)，因?yàn)閷?duì)純生物方向一點(diǎn)也不感興趣，所以課題方向選的是生信—TCGA數(shù)據(jù)的利用，雖說本科專業(yè)與生物相關(guān)，但在整個(gè)大...
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Linux文本操作常用命令在Linux系統(tǒng)里常用于文本查看、操作、統(tǒng)計(jì)的命令： ? head/tail，cat/tac，less/more? wc，sort，uniq? cut，paste 通過多敲鍵...
