reduce_dimension()的preprocess_method默認(rèn)是“LSI”。preprocess_method：
A string indicating the preprocessing method used on the data. Options are "PCA" and "LSI". Default is "LSI".
單細(xì)胞之軌跡分析-3：monocle3軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 單細(xì)胞之軌跡分析-2：mono...
有個問題想請教一下，pre-branch 1使用的應(yīng)該是4、2和1才對。7是branch 2分出來的，如果包括了7，也應(yīng)該包括3才對，3和7都是分支分出來的。按照括號里的英文解釋以及github上原作者對該問題的回答（https://github.com/cole-trapnell-lab/monocle-release/issues/219），這里的pre-branch 1使用的應(yīng)該是4、2和1才對。
單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
這是我見過最全的關(guān)于monocle2的文章。有很多大家常用卻并不十分清楚的知識點(diǎn)本文都講到了。謝謝！
單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
視頻鏈接：https://www.youtube.com/watch?v=XmHDexCtjyw&list=PLjiXAZO27elC_xnk7gVNM85I2IQl5BEJ...
1 背景 假設(shè)現(xiàn)在我們調(diào)查了一些人的身高和體重，并繪制了二維圖。通過觀察我們發(fā)現(xiàn)這些點(diǎn)可以分成兩大類（綠色和藍(lán)色），灰色點(diǎn)為離群點(diǎn)。 但是，與之前見過的聚類所不同的是，綠色類...
Principal Component Analysis (PCA) 1 PCA原理 1.1 背景 假設(shè)我們測序了9個基因在2個細(xì)胞中的表達(dá)量并繪制成圖。細(xì)胞1和細(xì)胞2呈負(fù)相...
