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呱_ae39

Bisulfitesequencing，實(shí)驗(yàn) BS 處理 C->U(T) 轉(zhuǎn)化效率并不是 100% 的，轉(zhuǎn)化失敗的部分 C 會(huì)成為假陽性信號(hào)，所以 BS 轉(zhuǎn)化率也是很重要的指...

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WGBS 實(shí)驗(yàn) BS 處理 C->U(T) 轉(zhuǎn)化效率不是 100% 的，轉(zhuǎn)化失敗的部分 C 會(huì)成為假陽性信號(hào)，所以 BS 轉(zhuǎn)化率也是很重要的指標(biāo)。計(jì)算轉(zhuǎn)化率需要建庫實(shí)驗(yàn)參入已...

呱_ae39

博主您好，我想知道文中所提到的DMR不是本來就是根據(jù)亞群之間得到的差異甲基化區(qū)間嘛，那拿DMR去做pca，好像本來就能分出亞群來吧。有點(diǎn)沒太理解這里做pca的目的，謝謝~

利用DMR進(jìn)行PCA分析

使用DMR進(jìn)行PCA的主要目的是為了探究亞群中DMR是否存在大的差異，可以將不同亞群分開。因?yàn)槲覀冎繢MR在植物中存在三種類型CG、CHG和CHH，那么我們就需要對三種甲基...

只看不寫_nathan

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呱_ae39

@Jason數(shù)據(jù)分析生信教室 明白了，謝謝您！

用R語言對vcf文件進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘.7 測序深度覆蓋度

目錄 前言[http://www.itdecent.cn/p/729673778e43] 方法簡介[http://www.itdecent.cn/p/d9bd081763...

Jason數(shù)據(jù)分析生信教室

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呱_ae39

您好，我想請問一下SNP的GT一欄如果是0/0的話，那不是代表基因型和reference的是一樣嗎，為什么0/0的位點(diǎn)也是SNP呢？望指教，謝謝！

用R語言對vcf文件進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘.7 測序深度覆蓋度

目錄 前言[http://www.itdecent.cn/p/729673778e43] 方法簡介[http://www.itdecent.cn/p/d9bd081763...

Jason數(shù)據(jù)分析生信教室

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