targetScan 基于文獻(xiàn)《Prediction of Mammalian MicroRNA Target 》中的敘述，往往通過miRNA的 seed region（5‘...
IP屬地：江蘇
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小結(jié)miRNA與mRNA/lncRNA互作的工具
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Python爬蟲，批量獲取知網(wǎng)文獻(xiàn)信息一、前言 最近臨近畢業(yè)，寫畢業(yè)論文需要從知網(wǎng)查找大量的文獻(xiàn)。但去知網(wǎng)一條一條進(jìn)去看摘要又略顯麻煩和浪費(fèi)時(shí)間。于是，反手寫一個(gè)爬蟲，批量獲取基本信息，豈不美哉？在開始這個(gè)項(xiàng)目之...
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轉(zhuǎn)錄組趨勢(shì)分析基本概念 表達(dá)趨勢(shì)分析（Series Test of Cluster）：將變化特征模式相似的基因歸類到一種變化趨勢(shì)中，從而找到實(shí)驗(yàn)變化過程中最具有代表性的基因集以及對(duì)應(yīng)的趨勢(shì)...
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如何獲取染色體長(zhǎng)度我們?cè)谧龌蚪M或者轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時(shí)候，經(jīng)常需要用到染色體的長(zhǎng)度。今天我們就來聊聊如何獲取染色體的長(zhǎng)度。我們以人的為例，給大家介紹兩種不同的方法，都要用到著名的公共數(shù)據(jù)庫UC...
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植物基因組數(shù)據(jù)庫
| Database | URL | Species || RARTF | http://rarge.gsc.riken.jp/rartf/ | 擬南芥 || AGRIS, ...
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【Pathview web】通路映射可視化前言 pathview是一個(gè)通路可視化友好的R包，最主要的是它支持多組學(xué)數(shù)據(jù)映射（基因/蛋白-代謝）。自己用過它的R包，后來發(fā)現(xiàn)有網(wǎng)頁版的，果斷介紹給學(xué)員。因?yàn)椴怀Ｓ茫涗浺?..
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使用Cytoscape中的Enrichmen進(jìn)行富集分析可視化tMapEnrichment Map是一個(gè)用于功能豐富可視化Cytoscape軟件的插件,必須使用任何可用方法在EnrichmentMap之外生成富集結(jié)果。將基因集（例如通路和Gen...
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富集分析結(jié)果展示（二）——富集分析圈圖“做cox比例分析和KM曲線結(jié)合分析，閾值該怎么選取，數(shù)據(jù)是否需要標(biāo)準(zhǔn)化等等問題的解決方法” 01—研究背景 對(duì)基因功能富集結(jié)果的展示有很多種展示方法，有人說氣泡圖展示富集結(jié)...
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零代碼差異表達(dá)分析, DESeq,limma,edgeR一網(wǎng)打盡
作為一個(gè)生物學(xué)家(zha)，差異表達(dá)分析似乎是一項(xiàng)必備的技能。然鵝對(duì)于一個(gè)沒有任何編程基礎(chǔ)的生物學(xué)家，寫代碼是那么神秘莫測(cè)而又遙不可及，讓人腦殼疼。那么今天小編就為大家介紹一...
