我只是知識(shí)的搬運(yùn)工~
IP屬地：江蘇
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RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差異基因分析→ggplot2作火山圖→biomaRt轉(zhuǎn)換ID并注釋請(qǐng)一定看這里：寫(xiě)下來(lái)只是為了記錄一些自己的實(shí)踐，當(dāng)然如果能對(duì)你有所幫助那就更好了，歡迎大家和我交流 差異分析流程: 1 初始數(shù)據(jù) 2 標(biāo)準(zhǔn)化(normalization)：D...
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WGCNA實(shí)例分析及解讀（附代碼）WGCNA分析基于兩個(gè)假設(shè)：1.相似表達(dá)模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關(guān)或處于同一通路，2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無(wú)尺度分布。基于這兩點(diǎn)，可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達(dá)相似性劃分為不同的模塊...
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免疫學(xué)碩士一枚～<br>生信熱愛(ài)者但是小白一枚~<br>目前成就為0~<br>加油哦，一大波成就正在路上啦~<br>啾~豬莎要加油哦~
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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GSEA學(xué)習(xí)筆記春節(jié)后的第一次寫(xiě)學(xué)習(xí)筆記，還是要提醒大家沒(méi)事別聚集、別聚集、別聚集！重要的事情說(shuō)三遍！ 前幾天看到公眾號(hào)里寫(xiě)了GSEA的文章，雖然我之前跟著很多網(wǎng)上的教程走過(guò)一遍GSEA分析...
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GSEA分析
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2020-02-12 Day 25 用CIBERSORT分析腫瘤浸潤(rùn)的免疫細(xì)胞（附代碼）因?yàn)樵诰W(wǎng)上看了一些視頻，然后用數(shù)據(jù)試了一下，發(fā)現(xiàn)一直在運(yùn)行，打開(kāi)代碼一看，發(fā)現(xiàn)是我看不懂的，也不知道哪錯(cuò)了，在網(wǎng)上搜了半天，不是要錢(qián)就是故意給你改錯(cuò)的，網(wǎng)頁(yè)版的注冊(cè)還不成功，...
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生信小白--關(guān)于批次效應(yīng)的學(xué)習(xí)及實(shí)戰(zhàn)參考教程：微信公眾號(hào)：生信星球批次效應(yīng)處理實(shí)例：combat和removebatcheffect的對(duì)比 特別感謝：人美心善愛(ài)護(hù)小白的花花老師小潔忘了怎么分身 作為一個(gè)非常想搞...
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ID轉(zhuǎn)換大全-2-illumina芯片的探針
ID轉(zhuǎn)換大全-2-illumina芯片的探針 基礎(chǔ)知識(shí)參見(jiàn)： NCBI的基因entrez ID相關(guān)文件介紹 ID轉(zhuǎn)換大全 生信人必須了解的各種ID表示方式 參考https:/...
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基因id轉(zhuǎn)換方法
1.一開(kāi)始是在DAVID中：不過(guò)轉(zhuǎn)換后的結(jié)果有些不全； https://david.ncifcrf.gov/ 2.后來(lái)用的biomart：這兩天突然升級(jí)更新用過(guò)不了，不過(guò)應(yīng)該...
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學(xué)習(xí)小組Day7--孫大雅不知不覺(jué)已經(jīng)到學(xué)習(xí)的最后一天了~今天是學(xué)習(xí)測(cè)序的相關(guān)基本知識(shí) 學(xué)習(xí)內(nèi)容 測(cè)序過(guò)程和原理（目前主流：illumina公司） 二代測(cè)序大體流程 怎么區(qū)分一二三代測(cè)序 NGS（高通...
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學(xué)習(xí)小組Day6--孫大雅對(duì)待R要高冷，拒絕可以拒絕的一切 1.高級(jí)的鏡像設(shè)置 不想每次打開(kāi)Rstudio都要運(yùn)行一遍鏡像配置，就需要用到R的配置文件.Rprofile 首先用file.edit()來(lái)...
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學(xué)習(xí)小組Day5--孫大雅今日是學(xué)習(xí)R的第二天~ 1.數(shù)據(jù)類(lèi)型（重點(diǎn)掌握向量、數(shù)據(jù)框） 包括： 向量（vector） 矩陣（Matrix） 數(shù)組（Array） 數(shù)據(jù)框（Data frame）：也就是表...
