發(fā)簡信
IP屬地：新澤西州
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一行代碼合并多個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
寫了個(gè)簡單的程序用于空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的和整合，包含的合并方法有以下幾種：1.CCA（基于Seurat）2.Harmony3.FastMNN（基于b...
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EX-ST 膨脹的空間轉(zhuǎn)錄組最近Nature Method 發(fā)表了一篇很有意思的文章，講述了一個(gè)基于Visium改進(jìn)型的空間轉(zhuǎn)錄組，文章借用了Mechanical expa...
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空間轉(zhuǎn)錄組---特斯拉 TESLAforST
這里的特斯拉不是電動(dòng)車，是一個(gè)最近（May 17，2023）發(fā)表在Cell Systems 上的一個(gè)用于空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的工具。TESLA (...
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CellDancer細(xì)胞不會跳舞我不知道，但似乎nature biotech的文章代碼會有毒。。。 CellDancer是最新發(fā)表在nature biotechno...
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科技已經(jīng)被智子鎖死nature 于2023 年年初發(fā)表了一篇文章，該文章評估了一下過去50年來科研文章的創(chuàng)新性。文章使用了一個(gè)叫做CD index 的打分系統(tǒng)：T...
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智能繃帶Nature Biotechnology 發(fā)了一篇無線智能繃帶的文章，很有意思。萬物既可以智能化啊。其設(shè)計(jì)是在電路板上加入了若干感應(yīng)器，將其貼于...
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為什么CytoTRACE會失效？CytoTRACE是 2020 年發(fā)表在Science 上的一個(gè)trajectory 推斷工具，其原理是基于一個(gè)經(jīng)驗(yàn)性的觀察，即基因表達(dá)數(shù)目和發(fā)...
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無知者無畏
最近在做一個(gè)SCENIC 下游的分析，看到了一個(gè)叫CSI（Connection specificity index）的東西，大概的原理就是利用A...
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CellRank
---我不生產(chǎn)代碼，我只是個(gè)代碼的搬運(yùn)工。 今天來盤盤這個(gè)新工具，這個(gè)工具的一大優(yōu)點(diǎn)就是在有或者沒有splicing數(shù)據(jù)的時(shí)候，都可以用，效果如...