越來越懶了，不想寫記錄呀！算了，強(qiáng)迫自己一把！ 水平有限，若有錯(cuò)誤，懇請(qǐng)指出！ 信使RNA ( messenger RNA, mRNA)加工過程中的精細(xì)調(diào)控對(duì)基因的表達(dá)具有重...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
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Dapars2 分析可變多聚腺苷酸化（APA 3’UTR）與腫瘤
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ChIPseeker | 詳解annotatePeak的三種注釋方式序 言 ??ChIPseeker用來注釋peak確實(shí)很方便，也內(nèi)置了不少的可視化函數(shù)可以用來展示結(jié)果。ChIPseeker基于annotatePeak函數(shù)做注釋雖然使用起來很...
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全基因組 - 人類基因組變異分析（PacBio) （5）-- pbsv以Pacific Biosciences （PacBio）公司為代表的第三代單分子實(shí)時(shí)熒光測(cè)序平臺(tái)為以測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)的科學(xué)研究帶來了革命性的突破。目前該技術(shù)廣泛應(yīng)用于基因組Den...
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生信分析|Minimap2+sniffles calling SVs
1、minimap2 Minimap2 is a fast sequence mapping and alignment program that can find over...
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全基因組 - 人類基因組變異分析 (PacBio） -- minimap2 + Sniffles2一、Minimap2 使用 官方網(wǎng)站：https://github.com/lh3/minimap2[https://github.com/lh3/minimap2] 1. ...
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利用HOMER預(yù)測(cè)目標(biāo)序列的motif（從運(yùn)行程序到結(jié)果解讀，以及注意事項(xiàng)）關(guān)于查找motif，目前有很多種軟件可以進(jìn)行預(yù)測(cè)。我所在的實(shí)驗(yàn)室通常使用FIMO（MEME套件里的一個(gè)），但是有很多文獻(xiàn)里也提到了HOMER這個(gè)軟件，并且不乏一些影響因子很高...
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2019-01-22 劉宋宗室死亡狀況調(diào)查報(bào)告劉宋宗室殘殺現(xiàn)象屢見不鮮，清人汪中《補(bǔ)宋書宗室世系表序》稱劉宋劉氏年中，皇族一百廿九人，被殺者百廿一，骨肉相屠害者八十人。據(jù)清代羅振玉《補(bǔ)宋書宗室世系表》統(tǒng)計(jì)，皇族一百...
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自制轉(zhuǎn)座子GTF轉(zhuǎn)座子數(shù)據(jù)庫(kù) ??上一篇《TEtranscripts：轉(zhuǎn)座子元件差異表達(dá)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkzODI1MjYyNA==&...
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CUT&Tag數(shù)據(jù)分析筆記（1）前幾天學(xué)習(xí)了文獻(xiàn)CUT&Tag[http://www.itdecent.cn/p/335aec753039]，了解了原理以后，可以跟著官網(wǎng)來學(xué)習(xí)如何分析CUT&Tag數(shù)據(jù)了...
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芯片數(shù)據(jù)分析流程0.安裝R包 1.下載數(shù)據(jù)，提取表達(dá)矩陣和臨床信息 檢查數(shù)據(jù)下載的完整性看兩個(gè)KB或MB大小是否一樣 2.分組信息&探針注釋 當(dāng)一列中一部分相同，一部分不相同，取不同部分時(shí) ...
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2020-02-08 根據(jù)DAVID結(jié)果做圖GOterm分析
##根據(jù)DAVID結(jié)果做圖GOterm分析，數(shù)據(jù)格式從DAVID中下載，先保存至txt,后用excel打開，再保存為CSV格式 x<-read.csv(file = "C:\...
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CUT&Tag數(shù)據(jù)分析筆記（2）在開始筆記之前我只想吐槽一下，官網(wǎng)里這一部分的代碼錯(cuò)的離譜?。?！各種報(bào)錯(cuò)報(bào)的我懷疑人生。。。 第四節(jié) 比對(duì)結(jié)果過濾和文件格式轉(zhuǎn)換 （一）利用比對(duì)質(zhì)量過濾比對(duì)上的【可選步驟】 ...
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牛角箱鲀 ·100G 數(shù)據(jù)過濾 10個(gè)線程 不到1個(gè)小時(shí) 已經(jīng)算可以了 關(guān)掉dup計(jì)算功能還會(huì)快
浩渺予懷 評(píng)論自fastp參數(shù)說明 -
工具向——簡(jiǎn)易番茄鐘
番茄工作法，一直耳聞，從未實(shí)踐過。之前預(yù)習(xí)迎考，時(shí)有動(dòng)力不足、精力不集中等狀況發(fā)生，效率低下，一天時(shí)間不知不覺就過去。而且對(duì)于實(shí)際的復(fù)習(xí)時(shí)間沒有把握，不知道時(shí)間丟到哪里去了，...
