MLST(multilocus sequence typing):多位點(diǎn)序列分型CG( clonal group):克隆群CC(clonal c...
如果你已經(jīng)有一個(gè)模擬的馬爾可夫鏈序列,并且希望根據(jù)這些模擬數(shù)據(jù)估計(jì)轉(zhuǎn)移概率,可以使用頻率法或最大似然估計(jì)來(lái)計(jì)算狀態(tài)之間的轉(zhuǎn)移概率。 1. 獲取模...
使用 sample_sequences = defaultdict(list) 和 sample_sequences = {} 創(chuàng)建字典有以下主...
我們知道conda在環(huán)境環(huán)境的時(shí)候一般采用的方法是: 但其實(shí)使用conda安裝環(huán)境并不限于create -n (或 --name)一種方法,還...
在擴(kuò)增子建庫(kù)過(guò)程中,如果不加入PhiX文庫(kù),而是在barcode(條形碼)位置增加幾個(gè)錯(cuò)位堿基(即引入少量的隨機(jī)堿基),可以達(dá)到與加入PhiX文...
在計(jì)算置信區(qū)間時(shí),使用引導(dǎo)法(Bootstrap)可以采用不同的抽樣方法。主要有兩種方式:總體數(shù)據(jù)的有放回抽樣和無(wú)放回抽樣。這兩種方法在計(jì)算引導(dǎo)...
一個(gè) Git 倉(cāng)庫(kù)常常有不同的分支,開(kāi)發(fā)者可以在各個(gè)分支處理不同的特性,或者在不影響主代碼庫(kù)的情況下修復(fù) bug。倉(cāng)庫(kù)常常有一個(gè) master ...
在 Git 中,當(dāng)你新建了一個(gè)本地分支后,需要將該分支推送到遠(yuǎn)端倉(cāng)庫(kù),以便其他協(xié)作者可以訪問(wèn)該分支。以下是具體的步驟: 新建本地分支假設(shè)你已經(jīng)在...
阿里云服務(wù)器安裝 Centos 系統(tǒng)后使用 free 命令查看內(nèi)存大小往往會(huì)發(fā)現(xiàn)比所購(gòu)買配置的標(biāo)稱內(nèi)存要小很多,2G 內(nèi)存的查出來(lái)只有 1756...