pySCENIC 軟件分析原理 利用GENIE3算法識(shí)別與轉(zhuǎn)錄因子共表達(dá)的基因集合，但結(jié)果包含大量的假陽(yáng)性結(jié)果和間接靶標(biāo)； RcisTarget通過(guò)基序富集分析來(lái)排除假陽(yáng)性和...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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pySCENIC 結(jié)果解讀 -
Transient hepatic reconstitution of trophic factors enhances aged immunity (part 6)Part6：DFI Immunological safety of DFI treatment Para1:為評(píng)估DFI治療的持續(xù)效應(yīng)與安全性，老年小鼠接受為期28天的DFI...
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Transient hepatic reconstitution of trophic factors enhances aged immunity (part 5)Part5：DFI rejuvenates antitumour responses Para1:本研究旨在探究DFI療法是否能夠改善衰老個(gè)體的腫瘤免疫治療效果。研究者在黑色...
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Transient hepatic reconstitution of trophic factors enhances aged immunity (part 4)Part 4 DFI strengthens vaccine responses Para1:隨著年齡的增加，T細(xì)胞介導(dǎo)的疫苗應(yīng)答效應(yīng)減弱。本研究選取成年（6周齡）和老年（7...
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Transient hepatic reconstitution of trophic factors enhances aged immunity (part 3)Part 3 DFI mitigates immune ageing phenotypes： Para1:隨著年齡增長(zhǎng)，胸腺功能逐漸退化，導(dǎo)致初始T細(xì)胞比例下降，記憶性和耗竭...
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Transient hepatic reconstitution of trophic factors enhances aged immunity (part 2)Part2: Reconstituting immune cues in the liver: Para1:鑒于老年個(gè)體胸腺功能退化，直接遞送mRNA難以有效表達(dá)蛋白。相比之...
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Transient hepatic reconstitution of trophic factors enhances aged immunity (part 1)T cell support signals decline with age Para1:為篩選能恢復(fù)免疫功能的信號(hào)分子，本研究對(duì)多個(gè)年齡點(diǎn)的小鼠進(jìn)行了分析（包括adult...
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Transient hepatic reconstitution of trophic factors enhances aged immunity (Abstract)利用 作為生物工廠 可增強(qiáng)老年免疫功能 隨著年齡增長(zhǎng)，T細(xì)胞功能發(fā)生衰退且受體多樣性降低，從而導(dǎo)致老年人機(jī)體免疫功能下降，表現(xiàn)為對(duì) 。目前已有一些恢復(fù)免疫功能的研究，但大多僅...
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DoubletFinder去除雙細(xì)胞(Seurat v4版本)官網(wǎng)上已經(jīng)將之前適配于Seurat v4版本的代碼刪了，有需要的從這里下載吧 通過(guò)網(wǎng)盤(pán)分享的文件：paramSweep_v4_DF.R鏈接: https://pan.baid...
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Mellon細(xì)胞密度
細(xì)胞狀態(tài)密度分布是表征表型景觀的關(guān)鍵指標(biāo)，對(duì)揭示分化、再生和疾病機(jī)制具有重要意義。Mellon是2024年發(fā)表在Nature Methods，通過(guò)單細(xì)胞或者空間單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組對(duì)...
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ccAFv2分析cell cycle status
Tips: Tip1. 當(dāng)前ccAFv2已經(jīng)有Python和R版本，本文是R版本的安裝和使用； Tip2.ccAFv2依賴(lài)tensorflow 2.12.0，而tensorf...
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基因互作圖pheatmap/corrplot分析目的組間gene-gene correlation宏觀比較，對(duì)差異較大的cluster可做進(jìn)一步分析，挑選出互作變化較大的gene 示例： Progressive pla...