Weighted Gene Co-Expression Network Analysis（加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析，簡稱WGCNA）可鑒定表達(dá)模式相似的基因集合（module）...
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2023-12-02轉(zhuǎn)錄組分析——WGCNA -
隨筆 | 理想主義的窮人，窮人的理想主義
午間忙完手頭事項(xiàng)，坐在電腦前，想起了中午與吳總聊到內(nèi)容，不禁感慨?；蛟S確實(shí)不是這個世界出了問題，而是我們出了問題。通俗一點(diǎn)來說，是我們并沒有清晰地認(rèn)識這個世界或者這個環(huán)境。說...
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【網(wǎng)絡(luò)圖】Gephi今天分享另外一個最近學(xué)習(xí)的一個畫圖的小技巧。 說到網(wǎng)絡(luò)圖的繪制，大家可能首先想到的是Cytoscape，它在生物學(xué)相關(guān)的領(lǐng)域應(yīng)用非常廣泛，我自己也是常用這個，但是總覺得調(diào)整起...
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已解決 | 在conda環(huán)境中無法找到GLIBCXX_3.4.21
有時候conda莫名奇妙就會丟失一些庫，幾周前運(yùn)行得好好的環(huán)境，卻在前天import torch的時候突然提示： 看提示發(fā)現(xiàn)，這是個conda環(huán)境，卻調(diào)用了系統(tǒng)庫。我確信我在...
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《機(jī)器學(xué)習(xí)實(shí)戰(zhàn)：基于Scikit-Learn、Keras和TensorFlow（第二版）》第15章 使用RNN和CNN處理序列第10章 使用Keras搭建人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)[http://www.itdecent.cn/p/86626c79814a]第11章 訓(xùn)練深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)[https://www.j...
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暫別簡書，后會有期
我不是老師，也不是大神，更不是前輩。我只是個普通的科研工作者，一個只想努力變得更好的人。 來到簡書快3年了，期間寫了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時wfh的時候?qū)懙?。至?..
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析全流程
拖拖拉拉用了一年時間才把GWAS整個流程捋完，從背景到code、還有過程中遇到的一些bug以及解決辦法，加起來也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清單，也許以后有新的方法或者...
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GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上）前言 在前面的一系列WGS文章中，我講述了很多基因數(shù)據(jù)分析的來龍去脈，雖然許多同學(xué)覺得很有幫助，但是卻缺了一個重要的環(huán)節(jié)——沒有提供實(shí)際可用的數(shù)據(jù)來實(shí)戰(zhàn)完成具體的流程，不能得...
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群體結(jié)構(gòu)分析 | Pophelper 的“平替版”寫在前面 終于到了這一天，我又撿起了七八年做群體分析的技能....只是那會我畫圖就用 ggplot2，而現(xiàn)在我只用「TBtools」?；谥販y序數(shù)據(jù)的群體結(jié)構(gòu)分析，很多時候，...
