????此前文章中小編已經給大家介紹了微生物群落組成多樣性分析的三大主要板塊——Alpha多樣性分析、Beta多樣性分析及群落結構組成分析。然而，在微生物高通量測序數(shù)據分析過...
IP屬地：山東
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基于R語言的微生物群落組成多樣性分析——RDA分析 -
科研繪圖找不到漂亮的顏色？看這里“在科研繪圖過程中，除了一些科研軟件自帶的顏色外，相信大家有時候也想自己為圖片進行配色，使圖片更加美觀生動，讓人眼前一亮，先上效果圖，順便分享一些配色方案！” “下面...
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繪制堆疊柱形圖（ggplot 2）使用群落微生物物種豐度表數(shù)據
群落微生物物種豐度表-繪制堆疊柱形圖（ggplot 2） 今天我們先來講一下如何利用細菌群落的高通量測序數(shù)據來繪制堆疊柱形圖來展示不同樣品中優(yōu)勢菌的相對多度。 話不多說，直接...
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研究生一枚，主要研究方向為植物內生菌及微生物相關內容，公眾號【科研后花園】，主要更新內容：1）基于R的科研繪圖；2）科研小技巧分享；3）繪圖技巧分享；4）科研網站分享。
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公眾號 R語言數(shù)據分析指南，歡迎大家關注
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Alpha多樣性指數(shù)求標準差及平均值
Alpha多樣性指數(shù)求標準差及平均值 現(xiàn)在使用高通量測序技術來對微生物群落來進行測序分析已經發(fā)展很多年了，在論文中經常有使用到Alpha多樣性來對微生物群落進行組內差異分析，...
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orthofinder安裝及使用教程安裝orthofinder 使用conda安裝 安裝軟件前，先設置一個小環(huán)境，不要直接在自己賬戶的當前環(huán)境內安裝軟件；你可以創(chuàng)建很多小環(huán)境名，有的小環(huán)境壞了，你不要就可以了...
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R語言：R語言調色板相信各位在肝圖表寫論文時，一定都會思考：這張圖表用啥顏色？論文整體配色搭配怎么把控才好看？ 畢竟高分期刊大牛文章的共通點，除了論文精彩，整體配色也十分具有吸引力。 許多在線配...
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R011 基本圖形-箱線圖boxplot()箱線圖（又稱盒須圖）通過繪制連續(xù)型變量的五數(shù)總括，即最小值、下四分位數(shù)（第25百分位數(shù)）、中位數(shù)（第50百分位數(shù)）、上四分位數(shù)（第75百分位數(shù)）以及最大值，描述了連續(xù)型變量的...
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ggplot2繪制箱線圖參考自https://www.cnblogs.com/ljhdo/p/4921588.html 作者：悅光陰 箱線圖通過繪制觀測數(shù)據的五數(shù)總括，即最小值、下四分位數(shù)、中位數(shù)、...
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R語言 ggplot2 多箱圖 多個箱線圖 分組箱線圖 多個箱線圖
ggplot2 多箱圖 多個箱線圖 分組箱線圖 使用本地數(shù)據 鳶尾花（yuān wěi hu?。┳鍪纠?結果輸出如下面的圖
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可能會用到的R語言包~5
1 ggpmisc 添加回歸曲線 2 ComplexUpset 維恩圖 3 colorfindr 提取圖片中的配色 4 flextable 統(tǒng)計模型快速出表格 參考微信公眾號...
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微生物多樣性qiime2分析流程(9) 數(shù)據可視化分析(中）之繪制相關性熱圖前面介紹了微生物多樣性如何整合數(shù)據并進行了基礎可視化分析，現(xiàn)在讓我們開始進行更加深入的相關性分析和差異分析（相關性熱圖，RDA，CCA，Lefse） 1. 相關性熱圖 一般我...
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相關性分析 Pearson 相關系數(shù) 和 Spearman 秩相關系數(shù)
分析連續(xù)變量之間線性相關程度的強弱，并用適當?shù)慕y(tǒng)計指標表示出來的過程稱為相關分析。本文主要介紹比較常用的 Pearson相關系數(shù)、Spearman秩相關系數(shù)。這兩個相關性系數(shù)...
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查找文獻綜述 —— web of science最近開始寫大論文，需要查閱很多綜述，并且導入到endnote里，隨手記錄下來，也許會幫助到大家。 Endnote的下載安裝，推薦這篇：https://mp.weixin.qq...
