????此前文章中小編已經(jīng)給大家介紹了微生物群落組成多樣性分析的三大主要板塊——Alpha多樣性分析、Beta多樣性分析及群落結(jié)構(gòu)組成分析。然而，在微生物高通量測序數(shù)據(jù)分析過...
IP屬地：山東
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基于R語言的微生物群落組成多樣性分析——RDA分析 -
科研繪圖找不到漂亮的顏色？看這里“在科研繪圖過程中，除了一些科研軟件自帶的顏色外，相信大家有時候也想自己為圖片進(jìn)行配色，使圖片更加美觀生動，讓人眼前一亮，先上效果圖，順便分享一些配色方案！” “下面...
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繪制堆疊柱形圖（ggplot 2）使用群落微生物物種豐度表數(shù)據(jù)
群落微生物物種豐度表-繪制堆疊柱形圖（ggplot 2） 今天我們先來講一下如何利用細(xì)菌群落的高通量測序數(shù)據(jù)來繪制堆疊柱形圖來展示不同樣品中優(yōu)勢菌的相對多度。 話不多說，直接...
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研究生一枚，主要研究方向為植物內(nèi)生菌及微生物相關(guān)內(nèi)容，公眾號【科研后花園】，主要更新內(nèi)容：1）基于R的科研繪圖；2）科研小技巧分享；3）繪圖技巧分享；4）科研網(wǎng)站分享。
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公眾號 R語言數(shù)據(jù)分析指南，歡迎大家關(guān)注
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Alpha多樣性指數(shù)求標(biāo)準(zhǔn)差及平均值
Alpha多樣性指數(shù)求標(biāo)準(zhǔn)差及平均值 現(xiàn)在使用高通量測序技術(shù)來對微生物群落來進(jìn)行測序分析已經(jīng)發(fā)展很多年了，在論文中經(jīng)常有使用到Alpha多樣性來對微生物群落進(jìn)行組內(nèi)差異分析，...
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orthofinder安裝及使用教程安裝orthofinder 使用conda安裝 安裝軟件前，先設(shè)置一個小環(huán)境，不要直接在自己賬戶的當(dāng)前環(huán)境內(nèi)安裝軟件；你可以創(chuàng)建很多小環(huán)境名，有的小環(huán)境壞了，你不要就可以了...
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R語言：R語言調(diào)色板相信各位在肝圖表寫論文時，一定都會思考：這張圖表用啥顏色？論文整體配色搭配怎么把控才好看？ 畢竟高分期刊大牛文章的共通點(diǎn)，除了論文精彩，整體配色也十分具有吸引力。 許多在線配...
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R011 基本圖形-箱線圖boxplot()箱線圖（又稱盒須圖）通過繪制連續(xù)型變量的五數(shù)總括，即最小值、下四分位數(shù)（第25百分位數(shù)）、中位數(shù)（第50百分位數(shù)）、上四分位數(shù)（第75百分位數(shù)）以及最大值，描述了連續(xù)型變量的...
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ggplot2繪制箱線圖參考自https://www.cnblogs.com/ljhdo/p/4921588.html 作者：悅光陰 箱線圖通過繪制觀測數(shù)據(jù)的五數(shù)總括，即最小值、下四分位數(shù)、中位數(shù)、...
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R語言 ggplot2 多箱圖 多個箱線圖 分組箱線圖 多個箱線圖
ggplot2 多箱圖 多個箱線圖 分組箱線圖 使用本地數(shù)據(jù) 鳶尾花（yuān wěi hu?。┳鍪纠?結(jié)果輸出如下面的圖
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可能會用到的R語言包~5
1 ggpmisc 添加回歸曲線 2 ComplexUpset 維恩圖 3 colorfindr 提取圖片中的配色 4 flextable 統(tǒng)計模型快速出表格 參考微信公眾號...
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微生物多樣性qiime2分析流程(9) 數(shù)據(jù)可視化分析(中）之繪制相關(guān)性熱圖前面介紹了微生物多樣性如何整合數(shù)據(jù)并進(jìn)行了基礎(chǔ)可視化分析，現(xiàn)在讓我們開始進(jìn)行更加深入的相關(guān)性分析和差異分析（相關(guān)性熱圖，RDA，CCA，Lefse） 1. 相關(guān)性熱圖 一般我...
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相關(guān)性分析 Pearson 相關(guān)系數(shù) 和 Spearman 秩相關(guān)系數(shù)
分析連續(xù)變量之間線性相關(guān)程度的強(qiáng)弱，并用適當(dāng)?shù)慕y(tǒng)計指標(biāo)表示出來的過程稱為相關(guān)分析。本文主要介紹比較常用的 Pearson相關(guān)系數(shù)、Spearman秩相關(guān)系數(shù)。這兩個相關(guān)性系數(shù)...
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查找文獻(xiàn)綜述 —— web of science最近開始寫大論文，需要查閱很多綜述，并且導(dǎo)入到endnote里，隨手記錄下來，也許會幫助到大家。 Endnote的下載安裝，推薦這篇：https://mp.weixin.qq...
