當(dāng)只有自己發(fā)生狀況時(shí)，歸結(jié)給運(yùn)氣和自己太菜；當(dāng)別人發(fā)生同樣的狀況時(shí)，歸結(jié)給共同的客觀原因，比如網(wǎng)速太慢、電腦太爛；當(dāng)偉大的互聯(lián)網(wǎng)告訴你有更多的人遭遇了同樣的困惑，才終于投向科...
發(fā)簡信
IP屬地：遼寧
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關(guān)于GSEA富集結(jié)果條目數(shù)一跑一變的迷思和恍然大悟 -
R繪圖(6): 拯救初學(xué)者——發(fā)表級(jí)繪圖全能包ggpubr今天花了很多時(shí)間整理這個(gè)包的繪圖函數(shù)，不得不說這個(gè)基于ggplot2的包，是真的友好，很適合初學(xué)者?？赡軐τ谑煜gplot2的人來說，ggpubr的存在有些多余，但這并不妨...
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R繪圖(4): 散點(diǎn)圖添加相關(guān)系數(shù)/回歸方程
屬于比較常用的技巧。下面我用ggplot2內(nèi)置數(shù)據(jù)集進(jìn)行演示： 先來看一下，僅有散點(diǎn)和擬合線的圖 如果想添加擬合的方程，可以使用ggpmisc包的stat_poly_eq()...
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ggplot2超詳細(xì)講解一.基本概念 "一張統(tǒng)計(jì)圖形就是從數(shù)據(jù)到幾何對象(geometric object, 縮寫為geom, 包括點(diǎn)、線、條形等)的圖形屬性(aesthetic attribute...
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aglient芯片原始數(shù)據(jù)處理本文講的是aglient芯片原始數(shù)據(jù)的處理，參考資料是limma 的userguide文檔。GEO數(shù)據(jù)庫下載的表達(dá)矩陣不符合預(yù)期，比如是空的，或者是有負(fù)值的，那我們就處理一下...
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分享各種各樣的科研日常。
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“Simplicity is the ultimate sophistication.”
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linux變更文件/文件夾權(quán)限使用Rstudio-server安裝包時(shí)，發(fā)現(xiàn)報(bào)錯(cuò) 請示大佬，大佬考慮從root賬號(hào)復(fù)制R包時(shí)，直接用root賬號(hào)復(fù)制了文件夾，導(dǎo)致沒有權(quán)限。 終端下查看如下： 顯示4.0文...
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Error in get(name, envir = asNamespace(pkg), inherits = FALSE) : 找不到對象'get_fun_from_pkg'問題來源 今天安裝clusterProfiler包的時(shí)候出現(xiàn)這樣的報(bào)錯(cuò) 解決思路 把錯(cuò)誤關(guān)鍵詞get_fun_from_pkg往搜索引擎里貼一下 顯示的版本是0.1.8。所以...
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linux下安裝nloptr、AnnoProbe
想使用geoChina，需要安裝AnnoProbe包。 報(bào)錯(cuò)。缺少nloptr包。 繼續(xù)報(bào)錯(cuò)。于linux環(huán)境中安裝nloptr 重新安裝包。成功。
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使用Rstudio下載GEO芯片數(shù)據(jù)學(xué)習(xí)GEO芯片數(shù)據(jù)下載時(shí)踩了各種坑。記錄如下：跟從老師講解，嘗試使用GEOquery下載： 報(bào)錯(cuò)。下載龜速，且報(bào)錯(cuò) Timeout of 60 seconds was rea...
