基因組特征（GenomicFeatures） 包括基因組上的基因模型（gene model）或其他序列特征（gene feature），如genes、exons、UTRs、t...
IP屬地：廣東
-
生信課程筆記8-序列特征和基因模型 -
【名詞解釋】synteny / collinearity / identity / similarity / homology1. synteny 和 collinearity 用來描述基因組的共線性 synteny 共線性：同源基因在相應(yīng)染色體上的保留collinearity 同線性：在synte...
-
蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫https://www.uniprot.org/[https://www.uniprot.org/] 1.UniProtKB 包括Swiss-Prot和TrEMBL數(shù)據(jù)庫Un...
-
進(jìn)化與同源前言 研究進(jìn)化的方式 1）研究化石。零散，不完整。2）利用比較生物學(xué)、比較解剖學(xué)和生理學(xué)等手段，確定大致的進(jìn)化框架。細(xì)節(jié)存在爭議 。3）分子進(jìn)化。利用軟件，從分子水平，構(gòu)建各...
-
批量截取基因序列很多基因組數(shù)據(jù)庫中只有基因組，CDS和蛋白質(zhì)序列，而沒有基因的序列，這就需要我們自己去提取 1. 輸入文件 首先我們需要知道所有基因在染色體上的位置信息，這個(gè)可以在基因組注釋...
-
通過多序列比對(duì)找到保守區(qū)域序列標(biāo)識(shí)圖 sequencelogo 工具使用 使用在線的工具，WebLogo3 字母大小都是根據(jù)上方的運(yùn)算求得的，通常來說出現(xiàn)次數(shù)多的字母，體積也就越大，而如果某一列只有一...
-
生信--RNA-Seq數(shù)據(jù)分析
使用的數(shù)據(jù)，雙端測序數(shù)據(jù)clean data 1 &clean data 2 1、bowtie建庫 bowtie2-build genome.fa genome_index ...
