clusterProfiler 是業(yè)界大神Y叔寫的一個(gè)R包,可以用來做各種富集分析,如GO、KEGG、DO(Disease Ontology analysis)、Reacto...
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隨著生物學(xué)背景知識(shí)的增加,單細(xì)胞圖譜的可視化直接用10X的Loup或者seurat的Dimplot函數(shù)直接繪制的umap/tsne圖往往很難達(dá)到要求了,這就要求我們提高繪圖技...
??最近一直在學(xué)習(xí)單細(xì)胞方面的知識(shí),無意中看到別人的帖子在分享如何畫堆疊的小提琴圖(StackedVlnPlot),順便就學(xué)習(xí)了一下。發(fā)現(xiàn)StackedVlnPlot圖確實(shí)看...
在NGS分析入門階段,我們不需要考慮太多的細(xì)節(jié),只用知道一個(gè)分析的大致流程并完整跑下來即可。太多的細(xì)節(jié),只會(huì)讓我們對(duì)于分析產(chǎn)生莫須有的恐懼,因此一些“無關(guān)緊要“細(xì)節(jié)就被我們刻...
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis 單細(xì)胞RNA測序(scRNA...
linux基本命令 第六章 Linux文件與目錄管理 極客學(xué)院服務(wù)器 高通量相關(guān)基礎(chǔ)知識(shí) 生信一百講 1、 Anaconda Anaconda是一個(gè)Python下和Canop...
一、什么是中心極限定理 在適當(dāng)?shù)臈l件下,大量相互獨(dú)立隨機(jī)變量的均值經(jīng)適當(dāng)標(biāo)準(zhǔn)化后依分布收斂于正態(tài)分布。每次從這些總體中隨機(jī)抽取 n 個(gè)抽樣,一共抽 m 次。 然后把這 m 組...
tags: Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對(duì)后續(xù)分析至關(guān)重要,去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率。Trimmomatic 是...
今天在Biostar上看到了這個(gè)關(guān)于samtools bedcov vs. bedtools coverage 問題的討論(https://www.biostars.org...