生物信息學(xué)專業(yè)<br>公眾號：生信學(xué)習(xí)手冊
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samtools使用大全
samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件（通常是短序列比對工具如bwa,bowtie2,hisat2,tophat2等等產(chǎn)生的，具體格式可以在消息框輸入“SAM”查看...
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生信技能樹，生信菜鳥團(tuán)，jimmy
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生信小白教程之Count轉(zhuǎn)TPM，F(xiàn)PKM相信很多科研工作者（不包括比我厲害的大佬們）在做轉(zhuǎn)錄組時(shí)，都是在公司做測序，然后數(shù)據(jù)也交給公司分析，又然后，期待做個(gè)差異分析，得出像下圖那么完美的熱圖。 然而，然而，，我們得...
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理解SAM文件格式以及過濾sam文件RNA-seq或者ChIP-seq等等測序的上游分析流程里的比對步驟相信大家都知道，我之前也只是按照各種教程去走流程，并沒有仔細(xì)的研究過每一步的內(nèi)容。今天這篇文章學(xué)習(xí)一下sa...
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學(xué)習(xí)小組Day7筆記-zkh測序 Sanger測序 ddNTP測序讀長長（1000bp），準(zhǔn)確通量低 二代測序 PE（Pair End雙端） 邊合成變測序（sequence by synthesis, ...
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學(xué)習(xí)小組Day6筆記-zkh配置鏡像源 options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/[https://mirr...
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學(xué)習(xí)小組Day5筆記-zkhR-數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 表格在R語言中叫數(shù)據(jù)框 函數(shù)或者命令不會(huì)用時(shí)，除了百度/谷歌搜索以外，用這個(gè)命令查看幫助：?read.table，調(diào)出對應(yīng)的幫助文檔，翻到example部分研究...
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學(xué)習(xí)小組Day4筆記-zkh安裝Rstudio電腦用戶名必須是英文（Desktop的上一級就是用戶名） 下載R和Rstudio Rstudio清華鏡像：Tools——Global options——pa...
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學(xué)習(xí)小組Day3筆記--zkh
如何在linux環(huán)境下安裝軟件——conda conda就是linux的應(yīng)用商店，日常生信使用小而精的Miniconda即可 安裝和使用Miniconda 安裝 百度/谷歌搜...
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學(xué)習(xí)小組Day2筆記-zkh一、什么是linux，什么是服務(wù)器？ 1. linux是什么？ Linux是個(gè)操作系統(tǒng)（OS），類似windows和Mac （1）應(yīng)用場景 應(yīng)用于supercomputer（...
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