samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件(通常是短序列比對工具如bwa,bowtie2,hisat2,tophat2等等產(chǎn)生的,具體格式可以在消息框輸入“SAM”查看...
相信很多科研工作者(不包括比我厲害的大佬們)在做轉(zhuǎn)錄組時(shí),都是在公司做測序,然后數(shù)據(jù)也交給公司分析,又然后,期待做個(gè)差異分析,得出像下圖那么完美的熱圖。 然而,然而,,我們得...
RNA-seq或者ChIP-seq等等測序的上游分析流程里的比對步驟相信大家都知道,我之前也只是按照各種教程去走流程,并沒有仔細(xì)的研究過每一步的內(nèi)容。今天這篇文章學(xué)習(xí)一下sa...
測序 Sanger測序 ddNTP測序讀長長(1000bp),準(zhǔn)確通量低 二代測序 PE(Pair End雙端) 邊合成變測序(sequence by synthesis, ...
配置鏡像源 options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/[https://mirr...
R-數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 表格在R語言中叫數(shù)據(jù)框 函數(shù)或者命令不會(huì)用時(shí),除了百度/谷歌搜索以外,用這個(gè)命令查看幫助:?read.table,調(diào)出對應(yīng)的幫助文檔,翻到example部分研究...
安裝Rstudio電腦用戶名必須是英文(Desktop的上一級就是用戶名) 下載R和Rstudio Rstudio清華鏡像:Tools——Global options——pa...
如何在linux環(huán)境下安裝軟件——conda conda就是linux的應(yīng)用商店,日常生信使用小而精的Miniconda即可 安裝和使用Miniconda 安裝 百度/谷歌搜...
一、什么是linux,什么是服務(wù)器? 1. linux是什么? Linux是個(gè)操作系統(tǒng)(OS),類似windows和Mac (1)應(yīng)用場景 應(yīng)用于supercomputer(...