前言 最近在跑一個(gè)很大的數(shù)據(jù)集，大概有3500條以上的基因序列，因?yàn)閿?shù)量太大，跑樹(shù)有點(diǎn)搞不定，特此來(lái)記錄一下這個(gè)過(guò)程 超過(guò)3000個(gè)基因組iqtree直接跑斷直接跑了iqtr...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：陜西
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生信log6細(xì)菌全基因組建樹(shù)|基于GTDB-KT抽單拷貝蛋白序列-iqtree2 && fasttree建樹(shù)
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7.1 GWAS：系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)——MEGA系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)是表明被認(rèn)為具有共同祖先的各物種/材料之間的演化關(guān)系樹(shù)形圖，用來(lái)描述物種（或材料、序列等）之間的分類和演化關(guān)系，是反映群體結(jié)構(gòu)最經(jīng)典、直觀、有效的方法；...
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MEGA 構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)步驟
【轉(zhuǎn)載】 分子進(jìn)化的研究對(duì)象是核酸和蛋白質(zhì)序列。研究某個(gè)基因的進(jìn)化，是用它的DNA序列，還是翻譯后的蛋白質(zhì)序列呢？序列的選取要遵循以下原則：1）如果DNA序列的兩兩間的一致度...
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MEGA 構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)網(wǎng)絡(luò)上關(guān)于構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)的教程非常多，這里只挑重點(diǎn)部分講解。 常見(jiàn)算法：Neighbor-Joining、Maximum Likelihood 1. 參數(shù)設(shè)置： Test of ...
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GATK4變異檢測(cè)（bwa+samtools+Picard+GATK）一.軟件下載安裝 ??bwa：https://github.com/lh3/bwa[https://github.com/lh3/bwa]安裝及命令詳解參考：http://st...
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生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級(jí)分析+多組學(xué)分析寫(xiě)在前面 其實(shí)很多作者已經(jīng)探索的差不多了，相關(guān)腳本、教程也很多，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時(shí)候感覺(jué)是浪費(fèi)時(shí)間，但是在寫(xiě)的時(shí)候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識(shí)，不斷記錄反思，也...
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Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq測(cè)序指南
Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq測(cè)序指南 github鏈接：harvardinformatics/ATAC-seq 參考文獻(xiàn)：ATAC-s...
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搬磚的工人<br>
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轉(zhuǎn)載ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
轉(zhuǎn)自：生信技能樹(shù)這是目前發(fā)現(xiàn)不錯(cuò)的ATAC系列，原作者在簡(jiǎn)書(shū)也有更新http://www.itdecent.cn/u/d5b900bea027 ATAC系列連載： ATAC...
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密碼解鎖（升級(jí)版）1.在xml里面配置背景圖片 2.在MainActivity里面添加按鈕圖片 2.1.計(jì)算dp對(duì)應(yīng)的像素值 2.2封裝同時(shí)需要用到的方法 2.2.1創(chuàng)建按鈕視圖設(shè)置圖片的大小...
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畫(huà)板——顏色板和按鈕創(chuàng)建一個(gè)類 在昨天的滑動(dòng)條下面創(chuàng)建畫(huà)板和顏色板 創(chuàng)建選擇按鈕 所用到的所有全局變量 創(chuàng)建init方法用于數(shù)組的初始化和背景的設(shè)置 創(chuàng)建畫(huà)布用于畫(huà)圖和數(shù)組的遍歷 創(chuàng)建touch...
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畫(huà)板——滑動(dòng)條創(chuàng)建一個(gè)類繼承與View 創(chuàng)建橫豎屏 創(chuàng)建一個(gè)畫(huà)布方法，畫(huà)背景條和進(jìn)度條 1.當(dāng)屏幕為橫屏的時(shí)候 2.當(dāng)屏幕為豎屏的時(shí)候 在畫(huà)布里面畫(huà)小圓點(diǎn) 創(chuàng)建畫(huà)筆的方法 在這個(gè)demo里...
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圖片實(shí)現(xiàn)動(dòng)畫(huà)
1.創(chuàng)建一個(gè)類繼承與Relativelaout并且實(shí)現(xiàn)它的兩個(gè)方法 2.創(chuàng)建一個(gè)init方法實(shí)現(xiàn)圖片的提取和添加 3.引用一個(gè)onSizeChanged方法來(lái)實(shí)現(xiàn)外部的圖片的...
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實(shí)現(xiàn)自定義動(dòng)畫(huà)
1.畫(huà)波浪線 -使用的全局變量 1.1創(chuàng)建一個(gè)類繼承與View并且實(shí)現(xiàn)它的兩個(gè)方法 1.2創(chuàng)建一個(gè)init方法用于畫(huà)筆的實(shí)現(xiàn)并且作為全局變量 1.3創(chuàng)建一個(gè)startWave...
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創(chuàng)建控件1.創(chuàng)建一個(gè)類繼承與Relativelayout 2. 3.用java代碼創(chuàng)建控件 4.使用xml創(chuàng)建控件 5. 6.初始化控件 7.創(chuàng)建按鈕，按鈕布局屬性和返回按鈕 8.用...
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Android小游戲和簡(jiǎn)單認(rèn)識(shí)內(nèi)容： 程序的目錄介紹草圖.png Activity的?生命周期Android界面大部分的控件都會(huì)提供很多方法這些方法只需要自己去重寫(xiě) 不需要自己主動(dòng)調(diào)用什么是Activ...
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階段性總結(jié)
在去年的一次宣傳中我也去看過(guò)了，但是那一次我沒(méi)有選擇報(bào)名因?yàn)槲矣X(jué)得在大學(xué)里面老師應(yīng)該會(huì)教給我們?cè)S多知識(shí)的，但是在上了一年的課過(guò)后我感覺(jué)真的越來(lái)越糊涂了感覺(jué)這一年里面許多知識(shí)都...
