前兩天釋放了一個(gè)插件，名為「CLI Program Wrapper Creator」，可用于打包所有軟件，腳本程序，分析流程為「界面化工具」。打包「界面化工具」，益處如下： ...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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視頻 | 無(wú)需編程！手把手教你制作「界面化軟件」，打包所有可用軟件、python/perl/R腳本 -
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GTF處理腳本 - GTFtoolsGTFtools：一個(gè)靈活而強(qiáng)大的GTF文件處理工具 GTFtools是一款用Python編寫的命令行工具，專門用于處理基因轉(zhuǎn)錄格式（GTF）文件。GTF文件是一種用于描述基...
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即日起「TBtools」關(guān)閉「高速插件商店」，讓往事隨風(fēng)~終于還是走到這一步，思來索去，我還是決定，直接「關(guān)閉」TBtools的「高速插件商店」。當(dāng)然，這對(duì)應(yīng)了兩個(gè)事情： TBtools 插件商店中又少了一個(gè)條目。「高速插件商店」本...
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Minimap2（2.20）使用記錄
文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用，有錯(cuò)誤請(qǐng)指出，我立刻改正！ 官方說明：https://github.com/lh3/minimap2#general[https://github...
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TCGA所有projects的信息
點(diǎn)擊查看，可以下載到自己本地 TCGA_projects:https://docs.qq.com/document/DYmtyanJwa3RDeW9T[https://doc...
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R包TCGAbiolinks獲取TCGA所有projects的信息可以使用 R 包 TCGAbiolinks 來獲取 TCGA 癌癥臨床信息 信息保存在projects.xlsx文件中，查看projects.xlsx (部分內(nèi)容預(yù)覽)：我保...
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awk 中的 BEGIN 和 END 的用法
awk中兩個(gè)特別的表達(dá)式，BEGIN和END。 這兩者都可用于pattern中，提供BEGIN和END的作用是給程序賦予初始狀態(tài)和在程序結(jié)束之后執(zhí)行一些掃尾的工作。 任何在B...
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【Seurat 官方教程】流程拆解 (一): 預(yù)處理（過濾細(xì)胞和標(biāo)準(zhǔn)化）
官網(wǎng)教程：外周血單個(gè)核細(xì)胞數(shù)據(jù)集 Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC)[https://satijalab.org/seurat...
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Orthofinder 2.3Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源，是指不同物種之間的基因，起源于共同的祖先，基因功能可能一樣，但又因?yàn)檫M(jìn)化的關(guān)系，使得功能有...
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差異可變剪接軟件哪家強(qiáng)？
作者： 童 蒙編輯：amethyst 可變剪接作為轉(zhuǎn)錄后修飾的重要環(huán)節(jié)，對(duì)細(xì)胞的活性和疾病的發(fā)生發(fā)展都有廣泛的作用。盡管目前軟件很多，但是軟件間的比較卻比較少。作者系統(tǒng)地...
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終止釋放-20210320 - Free！公益釋放 | 任何人都能分析 RNAseq 原始數(shù)據(jù)了，只要你用 TBtools ！寫在前面 六年前，我著實(shí)開發(fā) TBtools 的主要目的之一，即“減輕科研人員數(shù)據(jù)分析負(fù)擔(dān)”，而后慢慢變化成現(xiàn)在的“降低甚至拆除部分生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析門檻”。基于這三五年的觀...
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如何將簡(jiǎn)單的問題整復(fù)雜……fasta序列長(zhǎng)度篩選寫在前面 看到一個(gè)問題，如何篩選fasta文件中基因序列長(zhǎng)度，當(dāng)時(shí)腦子里想到了最近正在學(xué)的東西。如何在linux下一行指令篩選fasta文件中序列長(zhǎng)度低于200的序列。 命令...
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基因家族鑒定流程（二） 用blast、mmseqs、diamond、hmmer搜索同源蛋白本文章將介紹 ①類blast軟件blast、mmseqs、diamond、hmmer的比較 ②blast、mmseqs、diamond、hmmer的使用 ③用四種軟件的實(shí)踐操...