問題 安裝R包（seqinr）時遇到以下問題（缺少config文件）： 從報錯信息可以看出報錯根本原因是找不到zlib.h 問題解決： 1，確認(rèn)是否安裝zlib 注：上述命令...
發(fā)簡信
IP屬地：澳門
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安裝R包 fatal error: zlib.h: No such file or directory 問題解決
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生者為過客，死者為歸人–讀《誰在銀閃閃的地方，等你》在華人的世界里，大家都愿意歌頌生，卻忌諱談?wù)撍?。生是希望，是延續(xù)，死是不可知的恐怖。 因為恐怖，所以焦慮。身體健康時，擔(dān)心會得病，得了病以后，擔(dān)心會死亡。我們急于逃離死亡的陰...
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TCGA|GEO可視化分析第1篇---相關(guān)性分析導(dǎo)讀：今天有小伙伴問我，篩選完差異基因后，想看自己關(guān)注的基因和其他基因的關(guān)系，應(yīng)該怎么做？那當(dāng)然要先做一下相關(guān)性分析了！好，下面讓我給大家娓娓道來...... 正文： ste...
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【R>>ggprism】Graphpad Prism繪圖風(fēng)格做科研的Graphpad Prism是避不開的一道關(guān)，那么是否可以用R來實現(xiàn)其繪圖風(fēng)格呢？在微信公眾號例竟然發(fā)現(xiàn)一篇好文，《一行代碼繪制Graphpad Prism風(fēng)格學(xué)術(shù)表...
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【R>>配對樣本】提取TCGA中的配對樣本
腫瘤研究中，常常需要關(guān)注癌和癌旁組織，這個時候就需要找出這些配對樣本。下面就來實戰(zhàn)吧！ 1.下載counts數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)為TPM counts轉(zhuǎn)TPM教程：【R>>IOBR】cou...
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【R>>DepMap】單基因腫瘤細胞表達情況CCLE是腫瘤細胞基因表達的百科全書，之前寫CCLE：求任意基因的相關(guān)性[http://www.itdecent.cn/p/59f979ab09ee]稍微介紹過其用法。今天...
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CCLE：求任意基因的相關(guān)性進行腫瘤的研究，求兩個或多個基因的相關(guān)性，可以用GEPIA2或者直接下載數(shù)據(jù)用R語言處理，如果能再加上細胞系的相關(guān)性就能完美了。下面就分享下，手動下載CCLE測序數(shù)據(jù)，求任意...
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單基因TCGA的Cox森林圖怎么畫才好看首先調(diào)取Xena網(wǎng)頁的TCGA數(shù)據(jù)做Cox生存分析，數(shù)據(jù)可以通過hiplot官網(wǎng)自主研發(fā)的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問https://hiplot.com....
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TCGA+biomarker——Cox回歸森林圖
森林圖簡介 森林圖（forest plot），從定義上講，它一般是在平面直角坐標(biāo)系中，以一條垂直于X軸的無效線（通常坐標(biāo)X=1或0）為中心，用若干條平行于X軸的線段，來表示每...
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單基因的腫瘤細胞系表達怎么看？CCLE告訴你泛癌的基因表達量一般可以用TCGA和GTEx實現(xiàn)，但是腫瘤細胞系一般用CCLE臨床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
