問題 安裝R包(seqinr)時遇到以下問題(缺少config文件): 從報錯信息可以看出報錯根本原因是找不到zlib.h 問題解決: 1,確認(rèn)是否安裝zlib 注:上述命令...
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在華人的世界里,大家都愿意歌頌生,卻忌諱談?wù)撍?。生是希望,是延續(xù),死是不可知的恐怖。 因為恐怖,所以焦慮。身體健康時,擔(dān)心會得病,得了病以后,擔(dān)心會死亡。我們急于逃離死亡的陰...
導(dǎo)讀:今天有小伙伴問我,篩選完差異基因后,想看自己關(guān)注的基因和其他基因的關(guān)系,應(yīng)該怎么做?那當(dāng)然要先做一下相關(guān)性分析了!好,下面讓我給大家娓娓道來...... 正文: ste...
做科研的Graphpad Prism是避不開的一道關(guān),那么是否可以用R來實現(xiàn)其繪圖風(fēng)格呢?在微信公眾號例竟然發(fā)現(xiàn)一篇好文,《一行代碼繪制Graphpad Prism風(fēng)格學(xué)術(shù)表...
腫瘤研究中,常常需要關(guān)注癌和癌旁組織,這個時候就需要找出這些配對樣本。下面就來實戰(zhàn)吧! 1.下載counts數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)為TPM counts轉(zhuǎn)TPM教程:【R>>IOBR】cou...
CCLE是腫瘤細胞基因表達的百科全書,之前寫CCLE:求任意基因的相關(guān)性[http://www.itdecent.cn/p/59f979ab09ee]稍微介紹過其用法。今天...
進行腫瘤的研究,求兩個或多個基因的相關(guān)性,可以用GEPIA2或者直接下載數(shù)據(jù)用R語言處理,如果能再加上細胞系的相關(guān)性就能完美了。下面就分享下,手動下載CCLE測序數(shù)據(jù),求任意...
首先調(diào)取Xena網(wǎng)頁的TCGA數(shù)據(jù)做Cox生存分析,數(shù)據(jù)可以通過hiplot官網(wǎng)自主研發(fā)的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問https://hiplot.com....
森林圖簡介 森林圖(forest plot),從定義上講,它一般是在平面直角坐標(biāo)系中,以一條垂直于X軸的無效線(通常坐標(biāo)X=1或0)為中心,用若干條平行于X軸的線段,來表示每...
泛癌的基因表達量一般可以用TCGA和GTEx實現(xiàn),但是腫瘤細胞系一般用CCLE臨床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...