https://github.com/nservant/HiC-Pro[https://github.com/nservant/HiC-Pro] 官方提供方式根本不行，yml...
IP屬地：江蘇
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HiC-Pro安裝記錄2025-11-10 -
轉(zhuǎn)錄組分析1——原始數(shù)據(jù)以及過濾Counts值 對(duì)給定的基因組參考區(qū)域，計(jì)算比對(duì)上的read數(shù)，又稱為raw count（RC）。計(jì)數(shù)結(jié)果的差異的影響因素：落在參考區(qū)域上下限的read是否需要被統(tǒng)計(jì)，按照什...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)過濾
1.下載數(shù)據(jù)過濾軟件fastp 2.使用fastp初步過濾數(shù)據(jù) 軟件基本用法 一般我們需要處理的數(shù)據(jù)都有幾十個(gè)，fastp過濾一個(gè)數(shù)據(jù)大約需要幾十秒，一個(gè)一個(gè)的逐一鍵入代碼去...
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ascpra下載GSA數(shù)據(jù)最近需要下載一批GSA數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)存放在國(guó)家生物信息中心GSA數(shù)據(jù)庫(kù)中，比如我需要下載的數(shù)據(jù)為CRA008542，我們一般要到GSA數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)搜索才能直達(dá)下載鏈接（圖1）。 點(diǎn)擊...
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YOLOv8 替換優(yōu)化器（Optimizer）許多時(shí)候我們會(huì)有一些對(duì)模型結(jié)構(gòu)進(jìn)行修改的需求，這個(gè)時(shí)候如何進(jìn)行模型改進(jìn)就成了我們的問題，接下來我的流程中將會(huì)介紹如何替換YOLOv8的優(yōu)化器。 1. 首先準(zhǔn)備代碼 比如我要將...
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GWAS理論 1-5 全基因組關(guān)聯(lián)分析結(jié)果解讀與經(jīng)典案例介紹一、主要結(jié)果 二、結(jié)果可視化與后續(xù)分析建議 置換檢驗(yàn)（Permutation test） bonferroni threshold 和 FDR 看我之前的簡(jiǎn)書文章有解釋 受...
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admixture 群體結(jié)構(gòu)分析http://dalexander.github.io/admixture/admixture-manual.pdf[http://dalexander.github.io/...
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沒遇到過這種問題...具體的問題是怎么樣的？
racon+pilon進(jìn)行三代+二代數(shù)據(jù)糾錯(cuò)
現(xiàn)在基因組組裝的流程一般是用nextdenovo直接組裝三代數(shù)據(jù)，但是三代數(shù)據(jù)組裝出來一般都會(huì)有一些問題，所以要對(duì)初步組裝結(jié)果進(jìn)行糾錯(cuò)。具體流程是先使用三代數(shù)據(jù)糾錯(cuò)，再使用二...
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@蘿北北唄 可以去掉的
mafft+iqtree構(gòu)建進(jìn)化樹
mafft可以用來進(jìn)行快速的序列比對(duì)，因?yàn)槠淇梢栽O(shè)置多線程。具體的命令行如下： 接下來等著運(yùn)算完就可以使用iqtree來建樹了，具體命令行如下： -b指代的是bootstra...
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序列比對(duì)軟件 MUMmer 結(jié)果可讀化處理（四）
關(guān)于該軟件的計(jì)算可選參數(shù)以及結(jié)果文件的解讀，見前三篇分享： 序列比對(duì)軟件 MUMmer 快速上手（一）[http://www.itdecent.cn/writer#/not...
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GFF文件和基因組文件提取mRNA,cds,protein序列首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,轉(zhuǎn)錄本序列 接下來我們利用組合工具來提取mRNA,和gene序列 注意用bedtools提取序列，要加-s 參數(shù)（能區(qū)分正反鏈...
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GenomeScope 2.0 評(píng)估基因組大小、雜合度和重復(fù)序列GenomeScope 是2017年發(fā)表在 bioinformatic 的一個(gè)工具，這個(gè)工具的目的就是處理一些高復(fù)雜度的基因組，比如說高雜合度或者基因組非常大的物種。Geno...
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Html項(xiàng)目使用vue
前言 近期維護(hù)一個(gè)項(xiàng)目，代碼是純html寫的，對(duì)于一個(gè)習(xí)慣了vue開發(fā)的人來說，純html太痛苦了，不能使用雙向綁定，不能使用組件，每次開發(fā)新功能，都非常的惡心；幸好，有一個(gè)...
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@fanren 有個(gè)問題，你這個(gè)是怎么解決跨源請(qǐng)求報(bào)錯(cuò)的，我一直報(bào)跨源請(qǐng)求錯(cuò)誤。
Html項(xiàng)目使用vue
前言 近期維護(hù)一個(gè)項(xiàng)目，代碼是純html寫的，對(duì)于一個(gè)習(xí)慣了vue開發(fā)的人來說，純html太痛苦了，不能使用雙向綁定，不能使用組件，每次開發(fā)新功能，都非常的惡心；幸好，有一個(gè)...
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這是Vue2還是Vue3啊？
Html項(xiàng)目使用vue
前言 近期維護(hù)一個(gè)項(xiàng)目，代碼是純html寫的，對(duì)于一個(gè)習(xí)慣了vue開發(fā)的人來說，純html太痛苦了，不能使用雙向綁定，不能使用組件，每次開發(fā)新功能，都非常的惡心；幸好，有一個(gè)...
