說人話版本： https://www.sci666.com.cn/59227.html
What are eigengenes and gene modules?最近在學(xué)習(xí)WGCNA時(shí)，遇到幾個(gè)名詞不是太懂是什么意思，在網(wǎng)上找了一下，發(fā)現(xiàn)有個(gè)答案但是正常上網(wǎng)是進(jìn)不去，所以我就把他拿過來共有需要的人學(xué)習(xí)學(xué)習(xí) one people I a...
感謝CJ對(duì)我上個(gè)插件的認(rèn)可和轉(zhuǎn)發(fā)，其實(shí)我的求學(xué)也不是太勵(lì)志，由于自己高考不好，所以先上的?？?，然后自己的運(yùn)氣不錯(cuò)，把專本碩博上全了，之后感謝導(dǎo)師和學(xué)校給我的機(jī)會(huì)，去國外學(xué)了一...
幾天前，與CJ討論，要開發(fā)用于轉(zhuǎn)錄組基因差異表達(dá)分析的插件，當(dāng)時(shí)CJ已經(jīng)有了想法，我想我就放棄吧，CJ說我們支持多人開發(fā)，我想想也對(duì)，參考CJ的插件，我添加了一些我的想法，既...
您好 我想問下在進(jìn)行SERRF運(yùn)算前是否要對(duì)原始數(shù)據(jù)預(yù)處理，比如NA imputation等
非靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)校正軟件之-SERRF@文章翻譯自SERRF主頁 SERRF是什么 SERRF的全名叫Systematical Error Removal using Random Forest SERRF是為大...
目前富集很多都是用Y叔的clusterprofier，或者使用GSVA，ssGSEA，但是是否還有其他的富集方式，實(shí)際上還是有的，不過中文的介紹很少，所以這活只能我來干了。。...
應(yīng)用場景 得到一組基因后想看這些基因或者蛋白質(zhì)在uniprot[https://www.uniprot.org/]中亞細(xì)胞定位的結(jié)果，我們以一個(gè)actin基因?yàn)槔?，我們之前?..
首先，vst也是基于負(fù)二項(xiàng)分布的一種標(biāo)準(zhǔn)化方法我們?yōu)槭裁丛诖髽颖緮?shù)據(jù)中需要采用vst的標(biāo)準(zhǔn)化方法呢？這是因?yàn)椋?1.It is a one-size-fits-all sol...
as.character(sapply(r[[1]], function(x) sapply(strsplit(x[1], ";"), function(x) x[1])))
生信擺渡 評(píng)論自從KEGG的pathway中提取gene symbol
沒有沒有，有老鐵私信我簡書怎么不更新了????我就粘貼過來了
「TBtools plugin」WGCNA shiny 使用說明原本以為畢業(yè)了就起飛了，沒想到，喵的比沒畢業(yè)還累...又鴿了仨月，這個(gè)小插件到時(shí)完善了不少，但是上次承諾的視頻還是沒有錄。原因不說了，準(zhǔn)備手打！ 還是寫個(gè)教程為好。錄視頻，怕...
原本以為畢業(yè)了就起飛了，沒想到，喵的比沒畢業(yè)還累...又鴿了仨月，這個(gè)小插件到時(shí)完善了不少，但是上次承諾的視頻還是沒有錄。原因不說了，準(zhǔn)備手打！ 還是寫個(gè)教程為好。錄視頻，怕...
test.log里面有報(bào)錯(cuò)信息，大概率是包沒裝上，不要急，關(guān)注CJ的公眾號(hào)生信藥丸，最近應(yīng)該有推文，OneStepWGCNA近期估計(jì)要下架，因?yàn)樽钚碌腤GCNAShiny插件要出了。而且有了更簡單的安裝插件方法。
『TBtools-plugin』OneStepWGCNA插件這個(gè)插件已經(jīng)下架了，上架了更好用的WGCNA shiny：http://www.itdecent.cn/p/4691c535a522[https://www.jianshu...
還是老習(xí)慣，給出官網(wǎng)教程，至于你是看還是不看，它就在那里，等著你的深入研究～ https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coexpress...
WGCNA分析中如何選擇軟閾值？這次依然還是給你拋出官網(wǎng)教程，依然是：你看還是不看，它就在那里，等著你的深入研究～ https://horvath.genetics.ucla...
??????寫的真好！
小鬼的WGCNA圖文詳解(一)--軟閾值最近有很多人在給他們做完了WGCNA分析之后，跑過來問結(jié)果中各種圖片的意思。我就整理一下WGCNA分析結(jié)果中常見圖片的含義吧，如有理解錯(cuò)誤，還請(qǐng)各位大神批評(píng)指正！ 首先，當(dāng)然...
最近有很多人在給他們做完了WGCNA分析之后，跑過來問結(jié)果中各種圖片的意思。我就整理一下WGCNA分析結(jié)果中常見圖片的含義吧，如有理解錯(cuò)誤，還請(qǐng)各位大神批評(píng)指正！ 首先，當(dāng)然...
clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包，看過了它的繪圖就會(huì)使人沉迷于其顏值無法自拔。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔，加上了我的測試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）。 一、...
