一、deepmod 1、三代測序得到的fast5文件是muti fast5，一個(gè)fast5文件里面有4000條fast5序列，deepmod不支持muti fast5，需要拆...
IP屬地：甘肅
-
三代ONT甲基化相關(guān)分析軟件
-
熱圖去掉聚類樹但是保留聚類
看到這個(gè)問題，你可能搜了好多答案，比如 熱圖如何去掉聚類樹的同時(shí)保留聚類的順序？ - 簡書 (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn/p/e...
-
我的生信自學(xué)心得分享
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年，我開始自學(xué)生物信息，那個(gè)時(shí)候，為了加深自己學(xué)習(xí)，所以就不間斷的在網(wǎng)上分享我的學(xué)習(xí)筆記。 我有一個(gè)自己的博客，xu...
-
轉(zhuǎn)座子（TE,散在重復(fù)）特征及其對(duì)基因組影響基因組中重復(fù)序列大體分為兩類：串聯(lián)重復(fù)（Tandem repeats，Tandem Duplication） （TRF可預(yù)測）散在重復(fù)（Dispersed repeats），...
-
gemoma安裝與簡單用法
gemoma是根據(jù)已知參考基因組的注釋，給未知基因組注釋的軟件，貌似網(wǎng)上僅僅有提到，卻沒有具體的用法，筆者研究了一下，寫下以下傻瓜式攻略，給大家參考安裝很簡單，直接用cond...
-
差異表達(dá)基因分析：差異倍數(shù)(fold change), 差異的顯著性(P-value)Differential gene expression analysis：差異表達(dá)基因分析 Differentially expressed gene (DEG)：差異表達(dá)...
-
RNA-seq(6): reads計(jì)數(shù)，合并矩陣并進(jìn)行注釋任務(wù) 1.實(shí)現(xiàn)這個(gè)功能的軟件也很多，還是煩請(qǐng)大家先自己搜索幾個(gè)教程，入門請(qǐng)統(tǒng)一用htseq-count，對(duì)每個(gè)樣本都會(huì)輸出一個(gè)表達(dá)量文件。2.需要用腳本合并所有的樣本為表達(dá)矩...
-
RNAseq006 轉(zhuǎn)錄組入門(6)：reads計(jì)數(shù)傳送門： RNAseq005 轉(zhuǎn)錄組入門(5)：序列比對(duì)RNAseq004 轉(zhuǎn)錄組入門(4)：參考基因組下載RNAseq003 轉(zhuǎn)錄組入門(3)：了解fastq測序數(shù)據(jù)RNA...
