load("GSE77532_exprSet.Rdata")
請問一下,"GSE77532_exprSet.Rdata"這個(gè)文件是怎么來的?
這個(gè)文件能不能幫寫下步驟?寫了很長,單沒法運(yùn)行。
GPL16686芯片平臺分析#芯片分析中經(jīng)常會遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前還沒有現(xiàn)成的R包可以用,因此分析方法也不統(tǒng)一。見生信技能樹...
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請問一下,"GSE77532_exprSet.Rdata"這個(gè)文件是怎么來的?
這個(gè)文件能不能幫寫下步驟?寫了很長,單沒法運(yùn)行。
GPL16686芯片平臺分析#芯片分析中經(jīng)常會遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前還沒有現(xiàn)成的R包可以用,因此分析方法也不統(tǒng)一。見生信技能樹...
不讓轉(zhuǎn)載也沒法復(fù)制代碼哦。。
某個(gè)基因與生存相關(guān)性曲線繪制學(xué)習(xí)R包ggstatsplot,survival,survminer 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備:矩陣"BLCA_93663_50_50.csv"下載自O(shè)ncolnc 生存分析在線工具基因:A...
學(xué)習(xí)R包ggstatsplot,survival,survminer 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備:矩陣"BLCA_93663_50_50.csv"下載自O(shè)ncolnc 生存分析在線工具基因:A...
最近聽了一個(gè)講座,里面提到了一些對于我來說比較陌生的技術(shù):CROP-seq、CRISP-seq、Perturb-seq。(雖然這些技術(shù)早在2017年就發(fā)表了)于是就查閱了文獻(xiàn)...
參考資料 南方醫(yī)科大學(xué)網(wǎng)紅博導(dǎo)Y叔的一本神奇的書https://yulab-smu.github.io/clusterProfiler-book/chapter12.html...
轉(zhuǎn)自“醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)園”微信公眾號。 讀入clinical.json文件 計(jì)算文件長度n,在這里n為348 初始化變量 利用一個(gè)for循環(huán)由json文件中提取信息 將提取的信息做成...
所涉及的函數(shù) Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...
網(wǎng)頁筆記摘抄:設(shè)置因子,按照對照在前,處理在后 group_list = factor(group_list,levels = c("control","treat")) 在...
WGCNA
WGCNA分析,簡單全面的最新教程本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程,參考了最新的文檔。第一全的還在路上,會出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測序分析實(shí)戰(zhàn)班上,歡迎點(diǎn)擊鏈接了解更多。 WGC...
寫在前面 這篇文章仍然來自幾篇文章及自己平時(shí)的積累,主要闡述關(guān)鍵基因和hub基因。很多人誤以為hub基因就是關(guān)鍵基因,甚至有人認(rèn)為差異表達(dá)基因就是關(guān)鍵基因。在正式看本文章之前...
一.知識回顧 1.回顧前兩天高頻實(shí)用命令paste0(“gene”,1:3) #paste0(rep(“gene”,3),1:3)的簡化寫法。注:引號英文格式k1 = rno...
生信技能樹1,2節(jié) 第一節(jié) R與R studio 1.創(chuàng)建R文件在file新建project,其格式為X.Rproj后續(xù)相關(guān)內(nèi)容均會保存在這個(gè)project 目錄下,便于管理...