pip本地安裝錯(cuò)誤 當(dāng)本地安裝 出現(xiàn)下面報(bào)錯(cuò) 可能有兩個(gè)原因 1，你的平臺(tái)不是Linux系統(tǒng)，需要重新下載對(duì)應(yīng)版本的whl文件。 2，可能下載的whl文件名不符合規(guī)范 首先查...
IP屬地：陜西
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# pip本地安裝錯(cuò)誤
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**服務(wù)器免密登錄**
在日常學(xué)習(xí)工作中，我們經(jīng)常需要連接遠(yuǎn)程服務(wù)器，每一次輸入密碼都很麻煩，或者是服務(wù)器本身設(shè)置就是必須免密登錄，所以今天我就交大家如何免密登錄，以及如何在xshell和vs co...
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2、RNAseq(2)--測(cè)序原始數(shù)據(jù)處理（Clean data）1、fastq文件 一般我們從公司里得到的原始測(cè)序數(shù)據(jù)都是屬于fastq.gz文件, .gz是一種壓縮格式的縮寫(xiě)，于是首先第一步是對(duì)這些壓縮格式進(jìn)行解壓操作 解壓好的文件即正...
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# sigprofiler的安裝與使用sigprofiler的安裝與使用 SigProfiler提供了一套完整的生物信息學(xué)工具來(lái)進(jìn)行突變特征分析。該軟件涵蓋了分析流程，從生成突變矩陣開(kāi)始，到完成特征提取，以及繪圖...
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寫(xiě)代碼時(shí)遇到的小問(wèn)題
有時(shí)我們?cè)跇?gòu)建函數(shù)后，用的時(shí)候會(huì)提示里面的一個(gè)對(duì)象找不到，比如： 但是我們仔細(xì)檢查函數(shù)，發(fā)現(xiàn)這個(gè)對(duì)象是存在的拆開(kāi)來(lái)運(yùn)行都不報(bào)錯(cuò)，但一封裝起來(lái)就報(bào)錯(cuò)。首先看你的對(duì)象是在函數(shù)外還...
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循環(huán)構(gòu)建多因素模型循環(huán)構(gòu)建多因素模型 目前在數(shù)據(jù)處理時(shí)，經(jīng)常會(huì)使用到回歸模型。有時(shí)你的自變量比較多，不想一個(gè)一個(gè)打，就需要構(gòu)建循環(huán)模型。循環(huán)模型根據(jù)單因素分析還是多因素分析，分為每次循環(huán)一個(gè)變...
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看下我下載hicpro2juicebox.sh的目錄
Hic-pro的結(jié)果文件轉(zhuǎn)化為.hic文件，在juicebox中實(shí)現(xiàn)可視化
hic數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)Hic-pro處理后，會(huì)生成allvalidpairs文件，這是所有有效配對(duì)的文件。一般想要可視化的話，比較復(fù)雜。這時(shí)我們就可以把它轉(zhuǎn)化為.hic文件，放到j(luò)u...
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幾種常用的差異分析方法簡(jiǎn)介幾種常用的差異分析方法簡(jiǎn)介 如今在生物學(xué)研究中，差異分析越來(lái)越普遍，也有許多做差異分析的方法可供選擇。但是在實(shí)際應(yīng)用中，大多數(shù)人不知道該使用哪種方法來(lái)處理自己的數(shù)據(jù)，所以今天...
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基因 ID 和 Symbol 轉(zhuǎn)換前言 看了這么多期的 circos，都有點(diǎn)乏了，換換口味也是好的。 下面，咱就開(kāi)始吧。 做生信分析，總是免不了要給基因 ID 和 Symbol 轉(zhuǎn)換來(lái)轉(zhuǎn)換去。 方法 一般要進(jìn)...
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整理ICGC 表達(dá)數(shù)據(jù)參考：ICGC數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)提取表達(dá)矩陣/如何提取癌癥數(shù)據(jù)--生信自學(xué)網(wǎng)使用spread 出現(xiàn)的坑--劉小澤簡(jiǎn)書(shū) 目的：當(dāng)我們使用TCGA 表達(dá)數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)以gene-sample...
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@c50ed7bb4362 直接搜鏈接轉(zhuǎn)化，第一個(gè)就是
使用wget下載GEO數(shù)據(jù)
我們有時(shí)需要下載GEO數(shù)據(jù)，使用getGEO的話比較麻煩，特別是當(dāng)我們只需要其中某一兩個(gè)文件時(shí)。但是當(dāng)我們直接復(fù)制文件鏈接，使用wget下載時(shí)，卻只能下載當(dāng)前的網(wǎng)頁(yè)。 經(jīng)過(guò)我...
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各種HIC處理數(shù)據(jù)之間的相互轉(zhuǎn)化
各種HIC處理數(shù)據(jù)之間的相互轉(zhuǎn)化 目前HI-C數(shù)據(jù)研究比較火爆，出現(xiàn)了各種各樣的工具來(lái)分析HI-C。這些工具各有優(yōu)缺點(diǎn)，而且對(duì)應(yīng)的有不同的下游處理工具。但這些工具的結(jié)果數(shù)據(jù)格...
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driver mutation 識(shí)別方法（部分簡(jiǎn)介）Driver mutation 識(shí)別方法（部分）簡(jiǎn)介 背景 眾所周知，癌癥的發(fā)生主要是由于突變的累計(jì)引起的，但是癌癥細(xì)胞中有著成千上萬(wàn)的突變，并不是所有突變都對(duì)腫瘤的演化具有...
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Hic-pro的結(jié)果文件轉(zhuǎn)化為.hic文件，在juicebox中實(shí)現(xiàn)可視化hic數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)Hic-pro處理后，會(huì)生成allvalidpairs文件，這是所有有效配對(duì)的文件。一般想要可視化的話，比較復(fù)雜。這時(shí)我們就可以把它轉(zhuǎn)化為.hic文件，放到j(luò)u...
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使用wget下載GEO數(shù)據(jù)我們有時(shí)需要下載GEO數(shù)據(jù)，使用getGEO的話比較麻煩，特別是當(dāng)我們只需要其中某一兩個(gè)文件時(shí)。但是當(dāng)我們直接復(fù)制文件鏈接，使用wget下載時(shí)，卻只能下載當(dāng)前的網(wǎng)頁(yè)。 經(jīng)過(guò)我...
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Hic-pro 的安裝
目前處理Hi-c數(shù)據(jù)的工具主要是Hic-pro和juicer。juicer相對(duì)來(lái)說(shuō)更好用一些，因?yàn)楦恿鞒袒恍?具體使用方法見(jiàn)《HIC數(shù)據(jù)介紹及相關(guān)分析》）但鑒于Hic-...
