01 題目 :Potential drug targets for multiple sclerosisidentified through Mendelian random...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：澳門
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發(fā)文新方向：11+高分藥靶孟德?tīng)栯S機(jī)化聯(lián)合共定位 -
高分SCI必須掌握國(guó)自然這一熱點(diǎn)：孟德?tīng)栯S機(jī)化+腸道菌群隨著對(duì)腸道菌群在人類健康中的重要性認(rèn)識(shí)的逐漸加深，越來(lái)越多的研究者開(kāi)始關(guān)注腸道菌群孟德?tīng)栯S機(jī)化（Gut Microbiota Mendelian Randomization，...
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ChIP-seq下游分析之motif 分析什么是ChIP-seq？ ChIP-Seq即染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）與二代測(cè)序技術(shù)的結(jié)合，通過(guò)染色質(zhì)免疫共...
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單細(xì)胞文章復(fù)現(xiàn)丨單細(xì)胞測(cè)序揭示肺腺癌中不同的腫瘤微環(huán)境模式文章標(biāo)題 Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironmental patterns in l...
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干貨分享|使用ssGSEA分析腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞上次的干貨分享我們給大家介紹的是如何利用TIDE預(yù)測(cè)腫瘤免疫逃逸（推文鏈接），本期推文更加重磅，我們將給大家詳細(xì)講解生信文章免疫分析必做的——腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞。 在學(xué)習(xí)腫瘤浸...
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1區(qū)SCI新寵丨生信分析+孟德?tīng)栯S機(jī)化強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合上大分?。?！生物信息學(xué)聯(lián)和孟德?tīng)栯S機(jī)化（Mendelian Randomization，MR）是一種最新流行的研究方法，結(jié)合了生物信息學(xué)和遺傳學(xué)的優(yōu)勢(shì)，旨在深入探究單個(gè)遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分（Ge...
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干貨分享|利用TIDE也能預(yù)測(cè)腫瘤免疫逃逸說(shuō)到免疫檢查點(diǎn)阻斷療法大家應(yīng)該都不陌生，其中，最富盛名的免疫檢查點(diǎn)就是PD-1/PD-L1了。表達(dá)在T細(xì)胞表面的程序性死亡受體（PD-1），與表達(dá)在腫瘤細(xì)胞表面的程序性死亡配...
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NHANES數(shù)據(jù)庫(kù)怎么學(xué)？NHANES數(shù)據(jù)庫(kù)怎么學(xué)？[https://mp.weixin.qq.com/s/XLCUFNQJEXd-UCrrAiZMbw] 國(guó)家健康和營(yíng)養(yǎng)檢查調(diào)查(NHANES，Nat...
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多組學(xué)水平的孟德?tīng)栯S機(jī)化分析+three-step SMR 應(yīng)用實(shí)操
多組學(xué)分析：在基因表達(dá)、表觀遺傳、蛋白、單細(xì)胞及微生物組學(xué)等水平上，利用組學(xué)數(shù)據(jù)比較不同組學(xué)水平的疾病和健康對(duì)照，從而鑒定潛在的致病機(jī)制。 藥物靶點(diǎn)孟德?tīng)栯S機(jī)化分析：探究是其...
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什么！繪制?；鶊D也有傻瓜式的操作啦？教你提升Figure的豐富度！在生信文章中，我們經(jīng)常會(huì)見(jiàn)到看起來(lái)很賽博朋克的桑基圖——豐富色彩的虛實(shí)結(jié)合，高級(jí)感滿滿。如圖1，一些ceRNA網(wǎng)絡(luò)相關(guān)的文獻(xiàn)就會(huì)用?；鶊D來(lái)直觀的展示lncRNA、miRNA、...
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詳細(xì)解讀！利用ieu數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行GWAS-GWAS共定位分析通過(guò)孟德?tīng)栯S機(jī)化分析，確認(rèn)了兩個(gè)疾病或性狀的因果關(guān)聯(lián)并且找到顯著信號(hào)位點(diǎn)后，需要解釋顯著信號(hào)位點(diǎn)是如何影響這兩個(gè)表型的。常見(jiàn)的一個(gè)解釋方法是共定位分析。 共定位分析通常用于鑒...
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表觀遺傳學(xué)結(jié)合轉(zhuǎn)錄組的多組學(xué)研究在癌癥診斷和治療中的應(yīng)用表觀遺傳學(xué)包括在不改變 DNA 序列的情況下染色質(zhì)的可遺傳結(jié)構(gòu)和生化改變 。表觀遺傳機(jī)制通過(guò)改變局部和全局染色質(zhì)的表觀遺傳密碼的可及性來(lái)調(diào)節(jié)相關(guān)基因表達(dá)，從而操縱各種生理和病...
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兩大經(jīng)典數(shù)據(jù)來(lái)源，帶你輕松搞定蛋白質(zhì)組學(xué)！
前面的推文（多組學(xué)聯(lián)合應(yīng)用···[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2ODk3NDkxOA==&mid=2247484306&idx=1&...
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保姆級(jí)教程！5分鐘學(xué)會(huì)繪制timeROC、multiROC（附示例數(shù)據(jù)）！文獻(xiàn)中常見(jiàn)的ROC曲線有兩種，一種是多時(shí)間點(diǎn)ROC（timeROC），是不同時(shí)間點(diǎn)下的ROC，最常見(jiàn)的為1、3、5年，如圖1；一種是多指標(biāo)ROC（multiROC），是不同變...
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PheWAS+GWAS直沖一區(qū)9+SCIPheWAS，全表型組關(guān)聯(lián)分析(又稱反向GWAS)，是考察全表型組范圍所有表型與某一SNP之間的關(guān)聯(lián)的方法。其主要是為了彌補(bǔ)GWAS在全基因組范圍發(fā)掘基因多效性方面的不足(G...
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手把手教你從GSEA下載目標(biāo)基因集并使用maftools包繪制瀑布圖！很多情況下，我們進(jìn)行生信分析都會(huì)有一個(gè)感興趣的點(diǎn)，可以是免疫、m6A甲基化、鐵死亡、銅死亡等等，但有很多小伙伴不知道到哪里去尋找并下載目標(biāo)基因集。本期推文，小碗不僅會(huì)給大家介...
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兩樣本孟德?tīng)栯S機(jī)化代碼實(shí)操
前面給大家介紹了孟德?tīng)栯S機(jī)化的概念和它所包含的內(nèi)容以及一些注意事項(xiàng)，忘記的同學(xué)可以復(fù)習(xí)一下哦（一文帶你讀懂孟德?tīng)栯S機(jī)化 - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[https://...
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基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)——多組學(xué)聯(lián)合應(yīng)用，你知道多少？各位小伙伴大家好，今天給大家分享的是我們經(jīng)常聽(tīng)到的一個(gè)名詞——組學(xué)，包括我們所知道的基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)以及代謝組學(xué)等?！敖M學(xué)”這個(gè)詞字如其面，也就是說(shuō)我們研究的是一...
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學(xué)森林圖？看這篇就夠了！在之前的推文（單因素、多因素COX回歸分析在R中的實(shí)現(xiàn)與常見(jiàn)問(wèn)題解答 - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn/p/0fa217a...