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    宏基因組之基因預(yù)測(cè)

    12年有篇BMC的文獻(xiàn)對(duì)幾款預(yù)測(cè)的軟件做了評(píng)估,其實(shí)參考大多數(shù)的文獻(xiàn)中最常見的倆個(gè)軟件也就是Prodigal和Metagenemark這倆個(gè)軟件,分析過程中我這倆個(gè)軟件都感受...

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    R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類熱圖 ComplexHeatmap(一)

    前言 使用 pheatmap 已經(jīng)能夠繪制滿足大多數(shù)要求的聚類熱圖了。 受 pheatmap 包的啟發(fā),ComplexHeatmap 提供了對(duì)熱圖更多更靈活的控制,如多數(shù)據(jù)熱...

  • 請(qǐng)問樓主 silva.16s_bacteria.tax 這個(gè)文件從哪里獲取

    微生物多樣性qiime2分析流程(4) 訓(xùn)練特征分類器進(jìn)行16s數(shù)據(jù)注釋

    經(jīng)過前面的分析步驟,我們得到了特征表,代表序列及進(jìn)化樹文件,并更改了其名稱;接下來就讓我們根據(jù)silva 138數(shù)據(jù)庫訓(xùn)練特征分類器來對(duì)代表序列進(jìn)行注釋: 1.導(dǎo)入?yún)⒖夹蛄袛?shù)...

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    (轉(zhuǎn)帖)R語言-ggplot2筆記:主題設(shè)置、存儲(chǔ)導(dǎo)出

    原文地址:https://mp.weixin.qq.com/s/xg7cggq45tBI0EQUSxPKFw 8.1 Introduction 第八章講的是ggplot2的主...

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    R數(shù)據(jù)可視化4: PCA和PCoA圖

    其實(shí)不論是PCoA還是PCA圖均是用散點(diǎn)圖來展示結(jié)果PCoA和PCA的結(jié)果,PCoA和PCA準(zhǔn)確來講是數(shù)據(jù)降維分析方法。順便值此佳節(jié),祝福各位和“科研”都能夠擁有幸福時(shí)光和美...

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